More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0098 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  100 
 
 		 140 aa  281  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  43.17 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  47.48 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2086  UspA domain protein  39.33 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  43.17 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0002  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 201 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  40.58 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  38.26 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  36.43 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 		 143 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  34.27 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  35.42 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.51 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  36.03 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  34.04 
 
 		 286 aa  71.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  32.37 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  33.81 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  31.11 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  33.57 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  35.33 
 
 		 320 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  34.69 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  36.84 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  33.33 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.43 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  31.94 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  33.33 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  37.75 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  35.04 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  34.03 
 
 		 300 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  32.87 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  32.86 
 
 		 288 aa  63.9  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.78 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  30.2 
 
 		 276 aa  63.9  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  37.09 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  32.37 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  34.72 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  33.1 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  32 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  35.66 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  32.12 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.3 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  30.66 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.97 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  35.97 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  36.77 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  35.34 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  33.58 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.72 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.22 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  34.93 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  35.66 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  33.1 
 
 		 317 aa  62  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  32.62 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  36.84 
 
 		 297 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.72 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  33.33 
 
 		 305 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  33.1 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.79 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1529  hypothetical protein  32.61 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  33.85 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  32.67 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.22 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  38.06 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  30.94 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  34.09 
 
 		 281 aa  60.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.5 
 
 		 290 aa  60.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  29.86 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  31.65 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  32.43 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  28.76 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.22 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  34.03 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  34.03 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  30.67 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  32.14 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  36.11 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>