More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2555 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  70 
 
 		 610 aa  865    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  70 
 
 		 610 aa  865    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  60.66 
 
 		 609 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  74.26 
 
 		 610 aa  919    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  85.92 
 
 		 611 aa  1033    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  81.31 
 
 		 610 aa  982    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  69.39 
 
 		 608 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  69.84 
 
 		 610 aa  862    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  74.47 
 
 		 630 aa  921    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  70.49 
 
 		 610 aa  871    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  70 
 
 		 610 aa  865    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  76.39 
 
 		 610 aa  925    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  70 
 
 		 610 aa  865    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  60.66 
 
 		 609 aa  713    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  61.15 
 
 		 609 aa  735    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  69.56 
 
 		 608 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  70 
 
 		 610 aa  865    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  70 
 
 		 610 aa  881    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  62.3 
 
 		 610 aa  725    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  81.48 
 
 		 619 aa  967    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  100 
 
 		 611 aa  1220    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  69.39 
 
 		 608 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  69.56 
 
 		 608 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  70 
 
 		 610 aa  868    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  74.43 
 
 		 610 aa  921    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  60 
 
 		 609 aa  725    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  62.46 
 
 		 610 aa  723    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  60.27 
 
 		 609 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  69.56 
 
 		 608 aa  858    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  69.67 
 
 		 610 aa  862    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  51.31 
 
 		 609 aa  594  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  49.18 
 
 		 620 aa  575  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  48.4 
 
 		 627 aa  535  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  45.75 
 
 		 613 aa  519  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  42.9 
 
 		 612 aa  428  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  41.89 
 
 		 609 aa  424  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  35.54 
 
 		 619 aa  375  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  36.28 
 
 		 616 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  35.54 
 
 		 588 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  37.42 
 
 		 609 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  35.92 
 
 		 621 aa  345  1e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  33.44 
 
 		 600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0107  Citrate transporter  36.75 
 
 		 545 aa  303  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0878847  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  29.53 
 
 		 596 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  29.36 
 
 		 602 aa  277  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  30.31 
 
 		 588 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  30.3 
 
 		 597 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  31.1 
 
 		 612 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  29.95 
 
 		 613 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  29.89 
 
 		 608 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  29.22 
 
 		 596 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  28.13 
 
 		 596 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  32.48 
 
 		 612 aa  252  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  31.8 
 
 		 589 aa  252  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  31.03 
 
 		 596 aa  251  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  30.78 
 
 		 591 aa  249  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  29.36 
 
 		 623 aa  248  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  30.72 
 
 		 627 aa  247  4.9999999999999997e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  29.87 
 
 		 604 aa  246  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  30.46 
 
 		 606 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  31.52 
 
 		 592 aa  243  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  29.23 
 
 		 588 aa  240  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  30.3 
 
 		 632 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  28.73 
 
 		 622 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  31.15 
 
 		 605 aa  239  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  30.51 
 
 		 592 aa  236  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  31.91 
 
 		 588 aa  236  9e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  27.7 
 
 		 590 aa  236  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  28.45 
 
 		 593 aa  236  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  27.75 
 
 		 590 aa  233  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  30.72 
 
 		 592 aa  233  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  30.72 
 
 		 592 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  29.61 
 
 		 588 aa  231  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2399  TrkA domain-containing protein  28.38 
 
 		 608 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.9987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  33 
 
 		 587 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  27.41 
 
 		 594 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.11 
 
 		 581 aa  227  5.0000000000000005e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  30.89 
 
 		 593 aa  226  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  30.43 
 
 		 592 aa  226  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  29.05 
 
 		 616 aa  225  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0490  Citrate transporter  30.29 
 
 		 605 aa  225  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  31.39 
 
 		 591 aa  224  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  28.55 
 
 		 593 aa  223  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  27.7 
 
 		 613 aa  222  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  29.41 
 
 		 591 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  29.21 
 
 		 614 aa  220  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  27.2 
 
 		 650 aa  219  8.999999999999998e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  30.08 
 
 		 588 aa  219  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  28.43 
 
 		 604 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  27.68 
 
 		 596 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  28.71 
 
 		 593 aa  217  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0502  TrkA-C domain protein  28.53 
 
 		 620 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  29.31 
 
 		 590 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  29.83 
 
 		 608 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  28.55 
 
 		 590 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  28.84 
 
 		 595 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  27.77 
 
 		 593 aa  213  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  28.78 
 
 		 619 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  28.26 
 
 		 599 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0233  putative citrate transporter  27.22 
 
 		 627 aa  211  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>