More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1995 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
443 aa  885  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  43.72 
 
 
454 aa  285  1e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.11 
 
 
1424 aa  247  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 
1105 aa  247  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  1.82587e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  37.99 
 
 
1328 aa  246  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.24 
 
 
771 aa  242  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
924 aa  239  6e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  38.08 
 
 
1039 aa  236  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.75 
 
 
787 aa  233  5e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  40.66 
 
 
911 aa  230  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
1215 aa  230  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  30.91 
 
 
725 aa  223  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  34.07 
 
 
1507 aa  221  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  40.9 
 
 
444 aa  216  5e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  33.78 
 
 
1288 aa  213  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.78 
 
 
885 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.68 
 
 
767 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  33.16 
 
 
799 aa  208  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.58 
 
 
1186 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.12 
 
 
991 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  38.54 
 
 
362 aa  200  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 
568 aa  190  3e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.33 
 
 
568 aa  190  3e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  35.03 
 
 
1131 aa  190  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.59 
 
 
2145 aa  187  5e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 
751 aa  186  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  37.42 
 
 
825 aa  184  2e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  30.89 
 
 
1044 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  34.6 
 
 
843 aa  182  8e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  34.84 
 
 
1290 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  41.08 
 
 
284 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  37.42 
 
 
311 aa  169  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  26.08 
 
 
1550 aa  167  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  27.22 
 
 
1050 aa  165  1e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
953 aa  163  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
669 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  35.64 
 
 
919 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  27.61 
 
 
1262 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  27.27 
 
 
822 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.48 
 
 
667 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
1128 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  26.85 
 
 
1488 aa  154  3e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  33.74 
 
 
493 aa  154  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.89 
 
 
694 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 
814 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 
785 aa  149  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  24.67 
 
 
1185 aa  149  1e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  31.79 
 
 
977 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  32.04 
 
 
672 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  41 
 
 
212 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 
857 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  31.97 
 
 
919 aa  142  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  25.82 
 
 
740 aa  142  1e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  31.66 
 
 
732 aa  142  1e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
1088 aa  142  2e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  33.33 
 
 
680 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 
481 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  27.05 
 
 
1040 aa  134  4e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  28.38 
 
 
708 aa  134  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  29.27 
 
 
1238 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  25.68 
 
 
1404 aa  127  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  27.25 
 
 
1125 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.87 
 
 
854 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
949 aa  121  2e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 
190 aa  121  2e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  26.75 
 
 
836 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  31.74 
 
 
1056 aa  119  8e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  32.34 
 
 
1429 aa  119  1e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
966 aa  116  1e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  29.36 
 
 
1106 aa  114  4e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  25.06 
 
 
1068 aa  113  7e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  25.58 
 
 
828 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  25.24 
 
 
686 aa  110  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
937 aa  110  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 
1283 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  28.03 
 
 
2327 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 
577 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
1028 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  31.15 
 
 
1475 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  26.68 
 
 
1313 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 
1479 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 
1054 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1359  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 
333 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  28.35 
 
 
1146 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 
776 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4168  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 
469 aa  97.1  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  26.79 
 
 
1212 aa  96.7  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  32.58 
 
 
304 aa  95.9  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
162 aa  93.2  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
851 aa  93.2  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  25.06 
 
 
1468 aa  93.2  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  28.06 
 
 
807 aa  90.5  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 
1415 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1060  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  26.86 
 
 
1435 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  25.19 
 
 
782 aa  87  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.79 
 
 
968 aa  86.3  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.81 
 
 
1611 aa  86.3  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  27.42 
 
 
963 aa  85.9  1e-15  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>