More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4090 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 705 aa  1446    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  58.06 
 
 		 711 aa  798    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 779 aa  294  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 702 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 757 aa  280  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 705 aa  276  9e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03830  putative TonB-dependent receptor protein  29.9 
 
 		 670 aa  266  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1927  TonB dependent receptor  28.8 
 
 		 725 aa  263  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0622578  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1863  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 781 aa  259  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150075  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 735 aa  257  6e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1883  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 702 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2258  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 708 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1609  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 684 aa  231  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.492474 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1896  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  24.79 
 
 		 687 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 675 aa  134  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  23.18 
 
 		 701 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 700 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 698 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.2 
 
 		 726 aa  128  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 678 aa  124  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 		 728 aa  118  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.22 
 
 		 721 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.22 
 
 		 706 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.22 
 
 		 706 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  22.91 
 
 		 706 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.22 
 
 		 706 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 700 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 700 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 700 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  23.78 
 
 		 710 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 700 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 706 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  21.29 
 
 		 706 aa  108  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 700 aa  107  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 692 aa  107  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 700 aa  107  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.1 
 
 		 700 aa  107  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.1 
 
 		 700 aa  107  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 700 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  21.13 
 
 		 678 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 715 aa  104  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 742 aa  103  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  23.37 
 
 		 712 aa  102  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 681 aa  101  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  24.45 
 
 		 623 aa  101  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.62 
 
 		 646 aa  101  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 730 aa  100  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 742 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  21.15 
 
 		 727 aa  100  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  22.46 
 
 		 703 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 704 aa  99.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 741 aa  98.6  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 666 aa  98.6  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 688 aa  98.6  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.64 
 
 		 705 aa  97.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03722  outer membrane hemin receptor signal peptide protein  24.38 
 
 		 741 aa  95.9  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000281288  normal  0.0836882 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 710 aa  96.3  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  23.97 
 
 		 713 aa  94.7  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 694 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 634 aa  94.7  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  21.88 
 
 		 704 aa  94.4  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  22.35 
 
 		 705 aa  94  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  21.88 
 
 		 715 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  21.54 
 
 		 681 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 701 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 		 673 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  23.88 
 
 		 690 aa  92.4  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  22.49 
 
 		 681 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.93 
 
 		 639 aa  91.7  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 701 aa  91.7  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5422  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 770 aa  91.3  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  20.35 
 
 		 726 aa  90.9  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  22.66 
 
 		 743 aa  90.5  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 777 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 777 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.92 
 
 		 862 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 624 aa  89  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  23.88 
 
 		 724 aa  89  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  21.03 
 
 		 736 aa  88.2  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  22.7 
 
 		 859 aa  88.2  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  22.9 
 
 		 715 aa  87.8  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 777 aa  87.4  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 709 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  23.12 
 
 		 689 aa  87  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  22.99 
 
 		 791 aa  87  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 705 aa  86.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  22.99 
 
 		 791 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 701 aa  85.5  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  22.13 
 
 		 703 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 757 aa  84.7  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 705 aa  84.7  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  20.47 
 
 		 656 aa  84.3  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  23.88 
 
 		 724 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  23.47 
 
 		 723 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  21.87 
 
 		 705 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  21.45 
 
 		 701 aa  84  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 678 aa  84  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  25.07 
 
 		 861 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5971  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 801 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900301  normal  0.0108971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>