104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3161 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  100 
 
 		 403 aa  843    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  40.85 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  37.53 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  38.31 
 
 		 386 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000712508  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  36.93 
 
 		 396 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  38.44 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  32.49 
 
 		 384 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  31.71 
 
 		 385 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  32.74 
 
 		 387 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  27.25 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2577  integrase  37.24 
 
 		 216 aa  126  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.922481 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  28.29 
 
 		 376 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5056  Phage integrase  25.06 
 
 		 473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3943  putative integrase  34.15 
 
 		 209 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  28.1 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2575  Phage integrase  36.55 
 
 		 147 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  25.95 
 
 		 433 aa  91.3  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  26.28 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  25.12 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  24.87 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  25.65 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  26.08 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  28.12 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  24.61 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  28.43 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  29.44 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  25.91 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  30.29 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  30.29 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  28.45 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.55 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  33.56 
 
 		 397 aa  67  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  24.7 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  26.27 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  35.88 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  24.27 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  20.51 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  20.51 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  20.51 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  28.93 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  0.0000214757 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  29.9 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.98 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  22.94 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  23.95 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  24.39 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  29.94 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  22.38 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  22.69 
 
 		 428 aa  57  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  22.49 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  22.99 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  23.17 
 
 		 297 aa  54.7  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.17 
 
 		 297 aa  54.7  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  26.45 
 
 		 273 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  28.91 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  27.41 
 
 		 276 aa  53.5  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  24.25 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  23.44 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  25.22 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  24 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.51 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  24.7 
 
 		 293 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.31 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0543  integrase family protein  26.91 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000277419  normal  0.0534863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  23.2 
 
 		 451 aa  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  23.4 
 
 		 304 aa  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  23.36 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3145  integrase family protein  25 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00138908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  23.43 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6841  integrase family protein  24.34 
 
 		 492 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  22.19 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  23.38 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  22.37 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  23.56 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  22.98 
 
 		 451 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  27 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  23.39 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  23.32 
 
 		 368 aa  46.6  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  23.73 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.3 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  22.87 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  23.55 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  23.27 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  22.27 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  27.37 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02901  hypothetical protein  22.95 
 
 		 354 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.338381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  22.3 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  20.69 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  21.45 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  29.93 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  23.33 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2118  integrative genetic element Gsu21, integrase  26.03 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  23.41 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  21.71 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  20.75 
 
 		 401 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1366  integrase family protein  28.3 
 
 		 447 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.571831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.01 
 
 		 296 aa  43.5  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  22.05 
 
 		 304 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>