More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2781 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 146 aa  299  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  32.8 
 
 		 213 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  32.8 
 
 		 213 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  32.84 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 219 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  36.73 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  27.82 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  27.82 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  31.71 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  25.36 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  28.79 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  32.23 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  28.46 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 178 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  28.03 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0360  MarR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  27.84 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 292 aa  54.7  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 164 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 170 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  30.3 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  25.2 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  26.35 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 182 aa  50.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  25.55 
 
 		 180 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6557  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>