More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0485 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 485 aa  986    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0920  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 512 aa  233  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.732822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1258  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 513 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1341  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 513 aa  232  9e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2924  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 514 aa  230  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.771721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3017  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 513 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.227562  normal  0.425104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2748  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 514 aa  229  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2826  major facilitator transporter  30.44 
 
 		 514 aa  229  8e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2851  transporter, putative  29.44 
 
 		 512 aa  229  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1331  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 513 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0891  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 510 aa  229  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.891594  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1505  transporter, putative  30.71 
 
 		 514 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1000  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 510 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1052  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 510 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2875  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 517 aa  226  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0914  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 511 aa  223  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2104  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 573 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2388  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 573 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.729986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1452  hypothetical protein  38.36 
 
 		 604 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2598  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 575 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.823661  normal  0.545914 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2005  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 573 aa  161  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.685164  hitchhiker  0.0000601576 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0597  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 475 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3854  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 469 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  24.14 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  23.84 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  23.98 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  25.98 
 
 		 451 aa  107  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  24.83 
 
 		 463 aa  103  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  24.21 
 
 		 462 aa  99.8  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  32.26 
 
 		 566 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  23.81 
 
 		 452 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  23.81 
 
 		 452 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  24.88 
 
 		 449 aa  97.8  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  24.88 
 
 		 449 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  25.29 
 
 		 461 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  24.71 
 
 		 461 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  25 
 
 		 449 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  24.83 
 
 		 461 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  25.06 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  25.06 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  25.06 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  25.06 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  25.29 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  25.61 
 
 		 490 aa  96.3  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  25.06 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  24.48 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  25.17 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  23.06 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  25.18 
 
 		 463 aa  94.7  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  25.18 
 
 		 395 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  23.72 
 
 		 489 aa  93.6  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  23.72 
 
 		 489 aa  93.6  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  23.56 
 
 		 464 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  23.39 
 
 		 504 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  22.65 
 
 		 490 aa  90.9  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  23.96 
 
 		 489 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  22.75 
 
 		 517 aa  90.1  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  23.79 
 
 		 527 aa  89.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  25.54 
 
 		 491 aa  89  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  22.74 
 
 		 489 aa  89  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  25.23 
 
 		 501 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  25.24 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  23.41 
 
 		 479 aa  87.4  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  25.73 
 
 		 446 aa  87  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  25.73 
 
 		 446 aa  87  7e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  29.39 
 
 		 467 aa  87  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  22.09 
 
 		 501 aa  86.7  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  22.79 
 
 		 444 aa  86.7  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  29.81 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  29.5 
 
 		 494 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  29.03 
 
 		 517 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  29.17 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  24.81 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1333  hypothetical protein  23.79 
 
 		 480 aa  84  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  31.88 
 
 		 516 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  30.65 
 
 		 496 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  29.9 
 
 		 516 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  22.84 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1438  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  30 
 
 		 683 aa  82  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  32.5 
 
 		 498 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2903  amino acid/peptide transporter  29.84 
 
 		 584 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422026 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1329  hypothetical protein  22.69 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  23.91 
 
 		 495 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  29.69 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  22.66 
 
 		 512 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  22.66 
 
 		 512 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  21.56 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  22.75 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  22.75 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  30.61 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  30.51 
 
 		 516 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  27.72 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  28.5 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  22.48 
 
 		 484 aa  78.2  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50811  POT family transporter: dipeptide/tripeptide:proton  22.47 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.030888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  22.06 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  21 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  31.31 
 
 		 539 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>