277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1329 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1333  hypothetical protein  98.54 
 
 
480 aa  936    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1329  hypothetical protein  100 
 
 
480 aa  950    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  36.08 
 
 
492 aa  267  2.9999999999999995e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  35.88 
 
 
492 aa  266  5e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  31.7 
 
 
497 aa  202  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  30.16 
 
 
502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  31.11 
 
 
516 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  28.44 
 
 
506 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  32.14 
 
 
534 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  28.73 
 
 
527 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  28.22 
 
 
506 aa  189  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  28.45 
 
 
501 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  29.44 
 
 
516 aa  189  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  30.02 
 
 
501 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  28.45 
 
 
501 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  28.45 
 
 
501 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  28.45 
 
 
501 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  28.45 
 
 
501 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  28.01 
 
 
500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  28.01 
 
 
500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  29.72 
 
 
500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  29.36 
 
 
500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  28.01 
 
 
500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  28.01 
 
 
500 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  28.01 
 
 
500 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  28.01 
 
 
500 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  28.01 
 
 
500 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  28.01 
 
 
500 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  30.08 
 
 
539 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  29.31 
 
 
539 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  29.31 
 
 
539 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  29.88 
 
 
544 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  29.31 
 
 
539 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  27.81 
 
 
506 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  27.35 
 
 
500 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  31.98 
 
 
528 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  28.95 
 
 
488 aa  176  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  30.41 
 
 
479 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  28.95 
 
 
501 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  32.21 
 
 
504 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  28.82 
 
 
511 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  28.18 
 
 
495 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0348  amino acid/peptide transporter  29.24 
 
 
500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.781642  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1531  amino acid/peptide transporter  29.24 
 
 
500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1721  amino acid/peptide transporter  29.24 
 
 
500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97984  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0382  amino acid/peptide transporter  29.24 
 
 
500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  28.14 
 
 
462 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1255  amino acid/peptide transporter  29.24 
 
 
551 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  30.09 
 
 
510 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3023  amino acid/peptide transporter  29.24 
 
 
500 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2907  amino acid/peptide transporter  29.24 
 
 
500 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  28.93 
 
 
544 aa  172  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  28.88 
 
 
490 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  28.88 
 
 
514 aa  170  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2221  amino acid/peptide transporter  28.85 
 
 
551 aa  170  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1177  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  30.27 
 
 
506 aa  170  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.980946  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  28.07 
 
 
489 aa  169  9e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  28.07 
 
 
489 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  28.07 
 
 
489 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  28.07 
 
 
489 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  28.07 
 
 
489 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  28.07 
 
 
489 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  28.07 
 
 
489 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  29.19 
 
 
495 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  28.07 
 
 
489 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  28.91 
 
 
496 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  27.91 
 
 
462 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3905  inner membrane transporter YhiP  28.1 
 
 
490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  28.1 
 
 
490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  28.1 
 
 
490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  28.07 
 
 
489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  30.04 
 
 
499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  28.1 
 
 
490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  28.32 
 
 
461 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  28.22 
 
 
461 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2927  amino acid/peptide transporter  29.4 
 
 
493 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0757  amino acid/peptide transporter  29.4 
 
 
493 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2946  amino acid/peptide transporter  29.4 
 
 
493 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0734  amino acid/peptide transporter  29.18 
 
 
493 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00669  predicted transporter  29.18 
 
 
493 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00658  hypothetical protein  29.18 
 
 
493 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  29.87 
 
 
510 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0799  amino acid/peptide transporter  28.79 
 
 
493 aa  166  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.256216  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0626  amino acid/peptide transporter  28.95 
 
 
493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  27.61 
 
 
506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0724  amino acid/peptide transporter  29.18 
 
 
493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470702  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  28.22 
 
 
461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  26.02 
 
 
507 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  28.8 
 
 
482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  28.37 
 
 
451 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0113  amino acid/peptide transporter  28.06 
 
 
506 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4868  amino acid/peptide transporter  28.18 
 
 
507 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5415  amino acid/peptide transporter  28.18 
 
 
506 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  29.12 
 
 
499 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4728  amino acid/peptide transporter  28.18 
 
 
506 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5316  amino acid/peptide transporter  28.02 
 
 
506 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179594  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5544  amino acid/peptide transporter  28.02 
 
 
506 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  28.29 
 
 
493 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  29.65 
 
 
520 aa  159  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  28.29 
 
 
493 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>