288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2903 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2903  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 584 aa  1173    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422026 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  53.42 
 
 		 533 aa  585  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1438  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  52.05 
 
 		 683 aa  409  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  34.34 
 
 		 527 aa  281  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  33.33 
 
 		 501 aa  259  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  32.46 
 
 		 497 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  29.98 
 
 		 544 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  29.06 
 
 		 584 aa  236  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0196  amino acid/peptide transporter  31.63 
 
 		 566 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  29.87 
 
 		 544 aa  232  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  28.96 
 
 		 507 aa  220  7e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  30.97 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  28.47 
 
 		 517 aa  213  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  44.92 
 
 		 490 aa  212  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  28.21 
 
 		 517 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  44.96 
 
 		 491 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  42.28 
 
 		 462 aa  205  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  43.36 
 
 		 489 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  43.25 
 
 		 451 aa  204  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  42.97 
 
 		 489 aa  203  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  42.13 
 
 		 489 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  35.63 
 
 		 479 aa  202  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  42.58 
 
 		 489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  42.58 
 
 		 489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  43.25 
 
 		 490 aa  200  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  42.74 
 
 		 462 aa  199  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  35.18 
 
 		 534 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  26.79 
 
 		 497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  41.42 
 
 		 501 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  41.42 
 
 		 501 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  28.43 
 
 		 517 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  41.42 
 
 		 501 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  41.57 
 
 		 324 aa  196  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  28.47 
 
 		 516 aa  196  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  41.2 
 
 		 501 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  33.85 
 
 		 498 aa  194  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  36.34 
 
 		 558 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  31.02 
 
 		 496 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  32.56 
 
 		 495 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  41.42 
 
 		 501 aa  189  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0078  amino acid/peptide transporter  27.74 
 
 		 603 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  39.74 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  39.74 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  32.66 
 
 		 516 aa  187  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  32.82 
 
 		 498 aa  187  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0163  amino acid/peptide transporter  31.14 
 
 		 707 aa  186  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  30.48 
 
 		 516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  42.86 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  30.98 
 
 		 499 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  39.33 
 
 		 500 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  31.74 
 
 		 497 aa  180  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  43.91 
 
 		 432 aa  179  9e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  34.47 
 
 		 504 aa  179  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  31.22 
 
 		 512 aa  178  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  31.22 
 
 		 512 aa  178  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0523  amino acid/peptide transporter  50.3 
 
 		 463 aa  176  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0510  permease  50.3 
 
 		 463 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  27.7 
 
 		 493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  27.66 
 
 		 489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  27.47 
 
 		 493 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  27.7 
 
 		 493 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  27.7 
 
 		 493 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  27.7 
 
 		 493 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  39.27 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  32.6 
 
 		 539 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  39.27 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  39.27 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  39.27 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  39.27 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  29.29 
 
 		 520 aa  172  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  32.6 
 
 		 539 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  39.27 
 
 		 461 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  32.6 
 
 		 539 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  39.27 
 
 		 461 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  38.87 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  25.22 
 
 		 492 aa  171  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  27.92 
 
 		 524 aa  171  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  38.87 
 
 		 461 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  32.46 
 
 		 539 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  31.25 
 
 		 497 aa  170  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  38.87 
 
 		 461 aa  170  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  25.04 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  31.7 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  25.04 
 
 		 500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  25.04 
 
 		 500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  25.04 
 
 		 500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  25.04 
 
 		 500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  25.04 
 
 		 500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  25.04 
 
 		 500 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  25.04 
 
 		 500 aa  167  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  29.9 
 
 		 510 aa  167  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  25.04 
 
 		 500 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  25.04 
 
 		 500 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  37.7 
 
 		 461 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  37.7 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  37.7 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  25.04 
 
 		 506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  40.57 
 
 		 490 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  39.69 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2927  amino acid/peptide transporter  26.28 
 
 		 493 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>