More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2246 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  100 
 
 		 188 aa  391  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  85.11 
 
 		 188 aa  322  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  80.85 
 
 		 188 aa  307  5e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  64.52 
 
 		 189 aa  267  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  36.41 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  37.77 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  34.92 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  36.72 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  37.7 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  35.26 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  34.9 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  34.38 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  35.64 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  34.78 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  35.47 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  32.6 
 
 		 194 aa  106  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  34.44 
 
 		 174 aa  104  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  34.27 
 
 		 192 aa  104  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  31.89 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  31.89 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  26.85 
 
 		 345 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  31.64 
 
 		 190 aa  91.7  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  31.76 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  33.92 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  33.57 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  33.33 
 
 		 166 aa  88.2  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  34.34 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  33.71 
 
 		 169 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.11 
 
 		 163 aa  85.1  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  32.02 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  27.57 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  32.59 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  26.9 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  30.86 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  28.89 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  31.75 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.8 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  31.49 
 
 		 176 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  30.34 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  28.99 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  27.12 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  26.9 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  34.76 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  30.9 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  30.9 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.65 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  29.78 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  28.25 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  28.25 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  34.81 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  27.93 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  26.63 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  31.21 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  29.28 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  27.47 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  29.38 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  26.49 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  27.81 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.65 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  26.38 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  28.26 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  29.84 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2018  nitroreductase  28.42 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.82 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  27.53 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  25.97 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.43 
 
 		 165 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  28.65 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  27.27 
 
 		 175 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.5 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  29.32 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.38 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  28.25 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  27.22 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  27.98 
 
 		 334 aa  64.7  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  29.89 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  27.27 
 
 		 274 aa  64.3  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  30.86 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  25.14 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  33.16 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  27.17 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.11 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  33.68 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  30.83 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  25.43 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  26.04 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.48 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1363  nitroreductase  26.63 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  27.49 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  25.95 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  30.18 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.17 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  25.79 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  22.82 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  31.58 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  26.15 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  26.87 
 
 		 278 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  26.23 
 
 		 273 aa  62  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  28.25 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  28.49 
 
 		 279 aa  61.6  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>