64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0313 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  100 
 
 
636 aa  1298    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  58.39 
 
 
631 aa  735    Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  33.81 
 
 
558 aa  217  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  32.56 
 
 
471 aa  212  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  33.93 
 
 
535 aa  204  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  33.67 
 
 
693 aa  204  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  31.69 
 
 
541 aa  202  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  31.12 
 
 
604 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  33.82 
 
 
547 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  32.01 
 
 
408 aa  195  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  34.53 
 
 
567 aa  194  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  31.57 
 
 
407 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  31.12 
 
 
387 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  32.73 
 
 
403 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  29.11 
 
 
408 aa  182  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  32.48 
 
 
727 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  31.47 
 
 
574 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  29.45 
 
 
411 aa  175  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  29.17 
 
 
399 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  30.45 
 
 
597 aa  169  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  31.94 
 
 
548 aa  168  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  30.37 
 
 
850 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  28.71 
 
 
535 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  28.64 
 
 
568 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  31.79 
 
 
535 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  26.93 
 
 
533 aa  145  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  27.68 
 
 
677 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  27.04 
 
 
532 aa  138  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  29.52 
 
 
658 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  29.81 
 
 
469 aa  133  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  25.58 
 
 
640 aa  133  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  28.61 
 
 
320 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  31.17 
 
 
413 aa  118  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  24.52 
 
 
583 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  24.89 
 
 
433 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.88 
 
 
445 aa  99  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  24.29 
 
 
434 aa  97.8  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  24.88 
 
 
450 aa  95.9  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  25 
 
 
427 aa  91.3  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  25.57 
 
 
589 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  23.67 
 
 
737 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  22.6 
 
 
453 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  26.6 
 
 
587 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  24.08 
 
 
612 aa  84.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  23.84 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  23.49 
 
 
441 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  22.57 
 
 
446 aa  81.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  23.99 
 
 
469 aa  79.7  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  23.08 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  23.13 
 
 
445 aa  67.8  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  36.27 
 
 
1069 aa  63.5  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  22.81 
 
 
435 aa  62.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.71 
 
 
1424 aa  57  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  23.3 
 
 
424 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  34.26 
 
 
1392 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  32.41 
 
 
970 aa  51.6  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  32.41 
 
 
693 aa  51.2  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  34.83 
 
 
601 aa  50.8  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  34.44 
 
 
1108 aa  49.7  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  30.97 
 
 
1119 aa  48.5  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  28.57 
 
 
2142 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  28.83 
 
 
1465 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  26.17 
 
 
818 aa  44.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  34.48 
 
 
812 aa  44.3  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>