More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4049 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  100 
 
 		 392 aa  816    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  58.52 
 
 		 380 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  56.87 
 
 		 386 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  54.9 
 
 		 800 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  53.41 
 
 		 820 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  52.94 
 
 		 792 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  49.87 
 
 		 881 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  48.18 
 
 		 867 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  46.45 
 
 		 871 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  47.72 
 
 		 860 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  47.47 
 
 		 856 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  46.15 
 
 		 838 aa  355  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  47.88 
 
 		 859 aa  355  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  47.01 
 
 		 859 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  47.01 
 
 		 859 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  47.17 
 
 		 859 aa  354  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  48.66 
 
 		 859 aa  353  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  46.74 
 
 		 859 aa  352  5e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  47.18 
 
 		 836 aa  351  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  49.7 
 
 		 779 aa  350  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  45.48 
 
 		 875 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  45.92 
 
 		 842 aa  348  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  47.57 
 
 		 884 aa  345  8e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  47.69 
 
 		 863 aa  343  2.9999999999999997e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  45.68 
 
 		 857 aa  343  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  46.49 
 
 		 852 aa  343  4e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  44.71 
 
 		 416 aa  338  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.98 
 
 		 872 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  44.76 
 
 		 826 aa  335  7e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  46.76 
 
 		 430 aa  329  7e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  44.29 
 
 		 841 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  47.09 
 
 		 811 aa  325  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  50.47 
 
 		 841 aa  314  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  45.45 
 
 		 419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  44.92 
 
 		 899 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 		 390 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  43.5 
 
 		 944 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  45.09 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  46.39 
 
 		 565 aa  294  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  40.17 
 
 		 352 aa  292  6e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  40 
 
 		 352 aa  292  9e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  39.72 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  45.21 
 
 		 325 aa  291  2e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  43.25 
 
 		 351 aa  289  7e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  43.33 
 
 		 757 aa  278  1e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  43.4 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  41.84 
 
 		 330 aa  272  9e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  38.94 
 
 		 387 aa  269  7e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  43.12 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  41.16 
 
 		 331 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  42.51 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  41.99 
 
 		 389 aa  256  6e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  39.7 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  40.96 
 
 		 393 aa  245  8e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  38.21 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  39.09 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.79 
 
 		 741 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.86 
 
 		 737 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.67 
 
 		 737 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  35.17 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  35.15 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  35.87 
 
 		 318 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  34.6 
 
 		 319 aa  169  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  34.6 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  34.19 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  34.08 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  35.13 
 
 		 325 aa  146  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  25.4 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  25.28 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  26.73 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  27.55 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  25.49 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  25.18 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  26.28 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  26.94 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  25.46 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  25.23 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  25.62 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  23.88 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  23.76 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  28.36 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  21.88 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  24.02 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  23.63 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  26 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  23.97 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5062  biotin synthase  23.19 
 
 		 333 aa  62.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  23.78 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>