More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1792 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1792  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  49.34 
 
 		 657 aa  241  5e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  51.32 
 
 		 230 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  50.44 
 
 		 236 aa  231  6e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  53.33 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  46.64 
 
 		 253 aa  228  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  48.21 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  48.66 
 
 		 229 aa  223  1e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 254 aa  223  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  52.25 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.79 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  47.11 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  48.42 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  48.42 
 
 		 236 aa  222  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  48.66 
 
 		 658 aa  222  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  48.67 
 
 		 260 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  44.93 
 
 		 228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  48.66 
 
 		 657 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  45.45 
 
 		 241 aa  221  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  47.53 
 
 		 241 aa  221  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  46.82 
 
 		 244 aa  221  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  45.54 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.09 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  48.21 
 
 		 657 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  46.43 
 
 		 228 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  47.3 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  47.03 
 
 		 235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  47.73 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  44.2 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  48.46 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.26 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  47.77 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  46.22 
 
 		 247 aa  218  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  48.88 
 
 		 230 aa  218  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  47.98 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  46.82 
 
 		 229 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  47.09 
 
 		 236 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  46.79 
 
 		 253 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  47.27 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  46.15 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  51.58 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  46.88 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  47.27 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  46.85 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  46.79 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0015  ABC transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 228 aa  217  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  51.13 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  45.98 
 
 		 645 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  48.43 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  47.96 
 
 		 240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2280  ABC transporter, ATP-binding protein  48.84 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0760186 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.27 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  48.44 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  48 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  47.35 
 
 		 264 aa  215  5e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  47.27 
 
 		 236 aa  214  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  49.1 
 
 		 235 aa  214  7e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  46.36 
 
 		 232 aa  214  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  47.77 
 
 		 656 aa  214  8e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1451  ABC transporter related  43.64 
 
 		 254 aa  214  8e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 		 222 aa  214  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.26 
 
 		 235 aa  214  9e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  47.35 
 
 		 653 aa  214  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  49.12 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  46.79 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0198  peptide ABC transporter ATPase  47.73 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.630395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  44.64 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  48.54 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0036  ABC transporter related  46.09 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00248641  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  45.91 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  46.67 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  47.3 
 
 		 715 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  45.54 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  45.98 
 
 		 248 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1663  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.557172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  45.29 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  45.18 
 
 		 667 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  45.18 
 
 		 682 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  46.12 
 
 		 271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.73 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  45.95 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  45.74 
 
 		 224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  47.16 
 
 		 247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  45.18 
 
 		 667 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2051  peptide ABC transporter ATPase  47.71 
 
 		 229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 230 aa  211  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  45.78 
 
 		 228 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  45.18 
 
 		 682 aa  211  9e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 228 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.19 
 
 		 648 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  50.24 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  46.46 
 
 		 228 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.19 
 
 		 648 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  45.41 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  46.19 
 
 		 648 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  45.91 
 
 		 228 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>