More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0989 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  97.41 
 
 
348 aa  705    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  97.13 
 
 
348 aa  703    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  97.41 
 
 
348 aa  705    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  97.41 
 
 
348 aa  705    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  97.13 
 
 
348 aa  703    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  91.09 
 
 
357 aa  669    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  97.41 
 
 
348 aa  705    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 
348 aa  719    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  97.13 
 
 
348 aa  702    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  97.41 
 
 
348 aa  706    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  97.41 
 
 
348 aa  704    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  76.81 
 
 
345 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  76.97 
 
 
345 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  65.7 
 
 
345 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  65.7 
 
 
345 aa  488  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  64.62 
 
 
344 aa  486  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  49.42 
 
 
359 aa  358  7e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  48.82 
 
 
354 aa  349  5e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 
345 aa  345  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  47.65 
 
 
345 aa  345  5e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  49.13 
 
 
371 aa  345  7e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  47.9 
 
 
345 aa  342  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  47.94 
 
 
340 aa  341  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  48.51 
 
 
355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  48.21 
 
 
361 aa  338  9e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  47.21 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  48.82 
 
 
365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  45.86 
 
 
401 aa  333  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  47.48 
 
 
353 aa  328  9e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  45.66 
 
 
357 aa  320  3e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  45.48 
 
 
369 aa  316  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  43.86 
 
 
360 aa  317  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  46.51 
 
 
352 aa  315  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  44.31 
 
 
360 aa  315  6e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  44.19 
 
 
368 aa  315  6e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  46.24 
 
 
348 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  45.16 
 
 
357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  44.51 
 
 
350 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  43.53 
 
 
355 aa  309  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  43.44 
 
 
354 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  45.72 
 
 
354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36030  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 
355 aa  299  5e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.142165  normal  0.921128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  44.25 
 
 
372 aa  299  6e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  44.44 
 
 
356 aa  299  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  44.44 
 
 
340 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  43.82 
 
 
356 aa  296  3e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  44.15 
 
 
340 aa  295  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2772  uroporphyrinogen decarboxylase  44.31 
 
 
345 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164918  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  43.62 
 
 
369 aa  292  5e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  44.67 
 
 
343 aa  292  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2494  uroporphyrinogen decarboxylase  44.02 
 
 
381 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2485  uroporphyrinogen decarboxylase  41.59 
 
 
353 aa  290  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  42.36 
 
 
372 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3249  uroporphyrinogen decarboxylase  40.75 
 
 
378 aa  290  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  42.36 
 
 
354 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  42.36 
 
 
354 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  43.11 
 
 
339 aa  288  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2481  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 
354 aa  287  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 
339 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3919  uroporphyrinogen decarboxylase  43.64 
 
 
354 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1585  uroporphyrinogen decarboxylase  43.84 
 
 
354 aa  282  8.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  41.52 
 
 
351 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  43.32 
 
 
356 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4010  uroporphyrinogen decarboxylase  42.27 
 
 
370 aa  271  9e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  40.64 
 
 
352 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  41.38 
 
 
350 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.76 
 
 
347 aa  266  4e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  41.38 
 
 
350 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  41.81 
 
 
340 aa  265  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 
342 aa  264  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  41.03 
 
 
355 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  42.2 
 
 
354 aa  259  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  39.83 
 
 
350 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15230  uroporphyrinogen decarboxylase  37.85 
 
 
407 aa  257  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.617606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1128  uroporphyrinogen decarboxylase  40.97 
 
 
350 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320103  decreased coverage  0.00101807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  40.91 
 
 
355 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  40.74 
 
 
355 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  40.46 
 
 
359 aa  256  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  40.29 
 
 
354 aa  255  6e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  41.19 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26750  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 
346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.506811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1088  uroporphyrinogen decarboxylase  41.55 
 
 
350 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 
340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  41.71 
 
 
355 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  40.46 
 
 
355 aa  252  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  39.31 
 
 
352 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  40.65 
 
 
339 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  39.38 
 
 
354 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  39.38 
 
 
354 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  39.38 
 
 
354 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  39.41 
 
 
356 aa  249  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  39.09 
 
 
354 aa  249  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  37.94 
 
 
348 aa  249  7e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  39.49 
 
 
354 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  39.09 
 
 
354 aa  249  7e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  39.09 
 
 
354 aa  249  7e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  39.09 
 
 
354 aa  249  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  39.32 
 
 
354 aa  248  9e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>