More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5002 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4698  TonB-dependent receptor  51.53 
 
 		 893 aa  857    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644067 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7317  TonB-dependent receptor  56.86 
 
 		 903 aa  931    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.924215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5002  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 935 aa  1885    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1447  TonB-dependent receptor  51.3 
 
 		 914 aa  848    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2994  TonB-dependent receptor  51.3 
 
 		 913 aa  847    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00795438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1726  TonB-dependent receptor  60.75 
 
 		 941 aa  1085    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0257056  normal  0.0675197 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6367  TonB-dependent receptor  60.44 
 
 		 941 aa  1087    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0355327  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6373  TonB-dependent receptor  50.21 
 
 		 906 aa  829    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1720  TonB-dependent receptor  50 
 
 		 906 aa  825    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1705  TonB-dependent receptor  50.21 
 
 		 906 aa  829    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1711  TonB-dependent receptor  60.44 
 
 		 941 aa  1087    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  35.73 
 
 		 874 aa  485  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  34.61 
 
 		 879 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  29.72 
 
 		 827 aa  299  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 869 aa  269  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 901 aa  267  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1806  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 927 aa  265  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.248046  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 928 aa  264  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 948 aa  262  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 852 aa  257  8e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 875 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 871 aa  254  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 884 aa  254  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  27.92 
 
 		 877 aa  253  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 904 aa  251  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 855 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  26.64 
 
 		 880 aa  245  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 847 aa  242  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  27.68 
 
 		 834 aa  241  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 861 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 861 aa  238  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 861 aa  238  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 861 aa  238  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 861 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 861 aa  235  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 849 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 857 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 891 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 1001 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 867 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 867 aa  209  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 854 aa  207  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 867 aa  207  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 867 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3813  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 991 aa  204  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.722498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 890 aa  195  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2244  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 892 aa  195  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 950 aa  194  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 866 aa  194  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 953 aa  192  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 882 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 882 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 890 aa  192  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 872 aa  191  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  24.26 
 
 		 899 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 869 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 873 aa  191  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  23.9 
 
 		 895 aa  190  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2169  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 1064 aa  189  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.576978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001855  outer membrane receptor protein  24.08 
 
 		 866 aa  188  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  23.37 
 
 		 896 aa  188  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 894 aa  187  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 944 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 956 aa  185  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 925 aa  185  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 886 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 838 aa  184  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 873 aa  183  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 869 aa  183  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 886 aa  183  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 910 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 897 aa  181  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 883 aa  181  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 883 aa  181  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1716  TonB-dependent receptor, plug  23.69 
 
 		 893 aa  181  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.716976  hitchhiker  0.000145025 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 855 aa  180  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 855 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 868 aa  178  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 894 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 883 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 843 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  24.58 
 
 		 884 aa  175  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 901 aa  173  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 841 aa  173  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 952 aa  173  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 975 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 876 aa  173  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 942 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 901 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 935 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 912 aa  164  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 904 aa  164  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 940 aa  162  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4602  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 875 aa  162  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.683128  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 904 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 		 974 aa  162  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4318  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 976 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.965607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  26.61 
 
 		 709 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 907 aa  160  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 976 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>