170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4358 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  300  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  98.65 
 
 		 148 aa  296  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  87.84 
 
 		 161 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  86.49 
 
 		 189 aa  263  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  86.49 
 
 		 189 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  85.81 
 
 		 189 aa  263  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  47.62 
 
 		 157 aa  103  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  49 
 
 		 202 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 167 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  50.53 
 
 		 158 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  37.24 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  44.12 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  39.31 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  47.83 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  46.74 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  42.42 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  34.81 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  40.96 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  27.97 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0562  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.490708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3666  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  29.36 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47580  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  21.82 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  25.23 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  25.83 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  35.94 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26770  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  21.82 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  20.9 
 
 		 223 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 162 aa  43.5  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0734  MarR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0770  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  29.41 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0825  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.4 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.4 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.63 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  29.63 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.4 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>