More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09350 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 704 aa  1445    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  65.26 
 
 		 690 aa  895    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  54.67 
 
 		 688 aa  744    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  46.92 
 
 		 713 aa  625  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  42.21 
 
 		 703 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  43.79 
 
 		 712 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  43.09 
 
 		 675 aa  559  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  41.82 
 
 		 710 aa  548  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  41.8 
 
 		 731 aa  547  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  41.86 
 
 		 696 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  40.79 
 
 		 711 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  35.19 
 
 		 687 aa  360  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  34.1 
 
 		 774 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  33.86 
 
 		 774 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  33.72 
 
 		 782 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  31.93 
 
 		 774 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  31.93 
 
 		 774 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  31.93 
 
 		 774 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  31.79 
 
 		 774 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 		 782 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  31.79 
 
 		 774 aa  306  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  31.12 
 
 		 777 aa  301  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 		 708 aa  296  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  31.56 
 
 		 784 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  30.91 
 
 		 693 aa  295  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  28.89 
 
 		 717 aa  294  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  31.36 
 
 		 784 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  31.37 
 
 		 784 aa  286  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 		 720 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  28.45 
 
 		 731 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 721 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 721 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 807 aa  269  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 723 aa  263  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 809 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  28.88 
 
 		 809 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 809 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 809 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 782 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 700 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  30.66 
 
 		 518 aa  128  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.63 
 
 		 705 aa  126  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  23.04 
 
 		 664 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  22.76 
 
 		 807 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 736 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 709 aa  108  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 821 aa  108  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  23.93 
 
 		 713 aa  106  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  23.92 
 
 		 846 aa  106  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 638 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 813 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 700 aa  102  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 665 aa  101  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 700 aa  100  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 700 aa  100  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 700 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 700 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 700 aa  99  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 700 aa  99  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 751 aa  99  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 644 aa  98.6  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 734 aa  97.8  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 723 aa  97.4  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.45 
 
 		 700 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.45 
 
 		 700 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 694 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  24.13 
 
 		 744 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  29.64 
 
 		 728 aa  96.3  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 738 aa  95.9  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  23.24 
 
 		 746 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 688 aa  95.1  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  24.19 
 
 		 744 aa  94.7  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 727 aa  94.4  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  21.58 
 
 		 729 aa  93.6  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 743 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  22.73 
 
 		 737 aa  92.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 647 aa  91.3  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 727 aa  90.9  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 665 aa  90.5  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 739 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  24.22 
 
 		 744 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  22.87 
 
 		 659 aa  89.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 730 aa  89  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0729  TonB-dependent receptor, plug  22.02 
 
 		 656 aa  88.6  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 652 aa  87.8  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 764 aa  87.4  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 731 aa  87.8  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  21.97 
 
 		 690 aa  87.4  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  22.22 
 
 		 653 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 702 aa  85.9  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0833  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0977  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 656 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 713 aa  84  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 653 aa  84  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1927  TonB dependent receptor  23.01 
 
 		 725 aa  83.2  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0622578  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 798 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 697 aa  83.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2896  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 686 aa  83.2  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  21.28 
 
 		 653 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>