173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3247 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1132 aa  2325    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  39.04 
 
 		 958 aa  599  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  22.65 
 
 		 946 aa  145  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  27.76 
 
 		 1087 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  26.8 
 
 		 1094 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.54 
 
 		 605 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  22.89 
 
 		 1171 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  25.59 
 
 		 1061 aa  110  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  26.07 
 
 		 975 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  32.81 
 
 		 916 aa  106  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1176 aa  106  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.47 
 
 		 1203 aa  104  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  27.25 
 
 		 1157 aa  102  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1092 aa  102  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  31.4 
 
 		 922 aa  101  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.03 
 
 		 1164 aa  101  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1062 aa  101  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  30.23 
 
 		 932 aa  101  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  26.78 
 
 		 1002 aa  101  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  23.61 
 
 		 1178 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  23.34 
 
 		 1178 aa  99.8  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1100 aa  94.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1126 aa  93.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  26.95 
 
 		 905 aa  93.2  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  26.95 
 
 		 905 aa  93.2  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  25.9 
 
 		 907 aa  92.4  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.62 
 
 		 1196 aa  92.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  25.67 
 
 		 914 aa  90.9  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1220 aa  90.9  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  27.05 
 
 		 908 aa  90.1  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  26.67 
 
 		 900 aa  90.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  24.8 
 
 		 1185 aa  89.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  25.27 
 
 		 1190 aa  88.2  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  29.04 
 
 		 925 aa  87.4  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  25.32 
 
 		 905 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  26.21 
 
 		 1335 aa  87  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  26.35 
 
 		 905 aa  87  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.22 
 
 		 1477 aa  87  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  26.35 
 
 		 905 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1126 aa  86.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  25.57 
 
 		 549 aa  85.9  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1049 aa  82.8  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  24.5 
 
 		 903 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  24.86 
 
 		 1056 aa  79.7  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  26.24 
 
 		 914 aa  79.3  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  27.66 
 
 		 928 aa  79  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  25.3 
 
 		 906 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  24.92 
 
 		 629 aa  76.6  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  31.75 
 
 		 752 aa  73.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  24.68 
 
 		 1999 aa  69.7  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  22.53 
 
 		 797 aa  69.7  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  28.85 
 
 		 758 aa  69.3  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  25.77 
 
 		 619 aa  68.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  24.46 
 
 		 1228 aa  68.6  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  37.5 
 
 		 716 aa  67.8  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  24.23 
 
 		 622 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1116 aa  67.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  25.43 
 
 		 622 aa  66.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  23.82 
 
 		 1790 aa  65.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  25.4 
 
 		 1490 aa  65.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  25.67 
 
 		 1697 aa  65.5  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  24.92 
 
 		 1121 aa  65.1  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  22.54 
 
 		 902 aa  64.3  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  22.35 
 
 		 1041 aa  64.3  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  26.28 
 
 		 1280 aa  63.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  28.76 
 
 		 2204 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  23.91 
 
 		 2245 aa  62  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  23.7 
 
 		 464 aa  62  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  23.91 
 
 		 1367 aa  62  0.00000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  23.49 
 
 		 1077 aa  61.6  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  24.34 
 
 		 934 aa  61.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  23.51 
 
 		 1575 aa  61.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  26.06 
 
 		 2013 aa  61.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1126 aa  60.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  22.54 
 
 		 1163 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1474 aa  60.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  23.46 
 
 		 1620 aa  60.1  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  25.09 
 
 		 986 aa  60.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  23.59 
 
 		 1082 aa  60.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  23.2 
 
 		 651 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  23.1 
 
 		 904 aa  59.3  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  21.94 
 
 		 1151 aa  59.3  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  23.53 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  24.83 
 
 		 1090 aa  58.5  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  24.56 
 
 		 2197 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  23.57 
 
 		 759 aa  58.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  26.32 
 
 		 1038 aa  58.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1118 aa  58.2  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  30.58 
 
 		 1196 aa  57.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  28.66 
 
 		 1629 aa  57.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  22.19 
 
 		 1822 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  27.27 
 
 		 606 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  31.82 
 
 		 643 aa  57.4  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  25.23 
 
 		 1489 aa  57.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1652 aa  57  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  23.25 
 
 		 759 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  21 
 
 		 609 aa  57  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  23.25 
 
 		 759 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  25.15 
 
 		 553 aa  57.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  25.15 
 
 		 553 aa  57.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>