More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2221 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3345  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.47 
 
 
1377 aa  1559  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1396  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.81 
 
 
1286 aa  1202  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1339  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  71.68 
 
 
1497 aa  1374  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0196  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.49 
 
 
1312 aa  1162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0298  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.21 
 
 
1488 aa  967  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4499  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  59.36 
 
 
1375 aa  1665  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0186  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  55.13 
 
 
1174 aa  729  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04530  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.5 
 
 
1383 aa  1581  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0997174  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3314  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.74 
 
 
1368 aa  1556  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3652  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.55 
 
 
1368 aa  1543  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220946  hitchhiker  6.67023e-06 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4475  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.52 
 
 
1342 aa  1544  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0736818  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1041  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.48 
 
 
1312 aa  1246  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1428  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  46.33 
 
 
1270 aa  1178  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.894677  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2848  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.72 
 
 
1368 aa  1557  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1347  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.66 
 
 
1387 aa  1653  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.039354 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2106  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.57 
 
 
1384 aa  1561  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0644464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0232  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.32 
 
 
1259 aa  1260  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.200123  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0319  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.24 
 
 
1302 aa  1182  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.672728  hitchhiker  0.00209442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3687  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  60.04 
 
 
1374 aa  1675  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.335052  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0288  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.29 
 
 
1301 aa  1012  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.120882  normal  0.0261022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0133  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.98 
 
 
1177 aa  857  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.46144e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1324  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.76 
 
 
1379 aa  1649  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.347511 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2960  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  59.1 
 
 
1390 aa  1660  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.514981  normal  0.612032 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5453  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.52 
 
 
1342 aa  1544  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182219  hitchhiker  0.00256328 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2866  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.23 
 
 
1342 aa  1531  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131495  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0490  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  58.14 
 
 
1362 aa  1622  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  1.21478e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4560  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.38 
 
 
1342 aa  1540  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.63321e-10 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4396  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.38 
 
 
1342 aa  1540  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0669661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0926  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  67.58 
 
 
1371 aa  1953  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2271  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  93.6 
 
 
1422 aa  2686  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0258  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  42.66 
 
 
1470 aa  1133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0398012  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4364  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.38 
 
 
1342 aa  1540  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.4876 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4483  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.38 
 
 
1342 aa  1540  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.977508  hitchhiker  0.00153179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4486  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.38 
 
 
1342 aa  1540  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  6.17327e-14 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0749  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.63 
 
 
1384 aa  1576  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.910245  normal  0.541943 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2679  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  45.71 
 
 
1303 aa  1161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.20242  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0268  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.01 
 
 
1368 aa  1563  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716165 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0042  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55 
 
 
1366 aa  1533  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.24956e-16 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3867  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.39 
 
 
1375 aa  1527  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3687  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  48.47 
 
 
1278 aa  856  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0193  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.79 
 
 
1322 aa  1526  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146327  hitchhiker  0.0018171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4325  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  59.24 
 
 
1143 aa  740  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.0767673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0268  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.59 
 
 
1378 aa  1640  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0702  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  62.1 
 
 
1368 aa  1708  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6057  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  60.16 
 
 
1141 aa  775  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0177  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.54 
 
 
1343 aa  1526  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0862378  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0277  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.53 
 
 
1342 aa  1539  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274525  normal  0.0126314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4324  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.15 
 
 
1343 aa  1519  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.397573  unclonable  9.17955e-10 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4528  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.52 
 
 
1342 aa  1544  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00027001  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4220  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.52 
 
 
1342 aa  1544  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000188468  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00225  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.38 
 
 
1342 aa  1536  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1862  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.01 
 
 
1377 aa  1611  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.310876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3364  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  60.89 
 
 
1358 aa  1699  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209145 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2729  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  59.99 
 
 
1362 aa  1704  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.466939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3860  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.81 
 
 
1342 aa  1542  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00178402  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0510  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.51 
 
 
1370 aa  1543  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301661  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0241  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.29 
 
 
1368 aa  1573  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.060417 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0328  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.01 
 
 
1375 aa  1614  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.853361  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2196  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.15 
 
 
1384 aa  1551  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.035759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0360  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  59.94 
 
 
1374 aa  1674  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.34888 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0319  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.01 
 
 
1368 aa  1564  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0158483  normal  0.343898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4697  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.8 
 
 
1343 aa  1525  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.117256  hitchhiker  3.43099e-06 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3839  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  59.6 
 
 
1374 aa  1655  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.353736  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4756  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  57.33 
 
 
1357 aa  1589  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4435  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.52 
 
 
1342 aa  1544  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.399722  decreased coverage  2.77463e-06 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4038  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.52 
 
 
1342 aa  1544  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0403787  hitchhiker  0.00374316 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0340  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.81 
 
 
1342 aa  1542  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0216  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  59.78 
 
 
1183 aa  764  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.846031  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0794  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.42 
 
 
1360 aa  1615  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0477  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  57.47 
 
 
1357 aa  1593  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0859  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.2 
 
 
1238 aa  897  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.88 
 
 
1177 aa  854  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4017  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  59.19 
 
 
1376 aa  1669  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.563725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2810  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.74 
 
 
1342 aa  1540  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102382  normal  0.453839 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2221  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  100 
 
 
1416 aa  2878  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480629  decreased coverage  0.00212341 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00025  DNA-directed RNA polymerase beta subunit  47.66 
 
 
1270 aa  1211  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002173  DNA-directed RNA polymerase beta subunit  56.38 
 
 
1342 aa  1542  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1138  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  57.26 
 
 
1168 aa  725  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4016  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  73.16 
 
 
1403 aa  2080  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.303023  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0316  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  56.08 
 
 
1388 aa  1555  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.376898  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0210  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.23 
 
 
1342 aa  1538  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0404668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0099  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.28 
 
 
1190 aa  871  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1532  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  63.17 
 
 
1126 aa  781  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1063  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  60.07 
 
 
1149 aa  736  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613328  normal  0.794281 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2072  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  57.96 
 
 
1363 aa  1602  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.244154  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0278  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.8 
 
 
1227 aa  762  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00054451  hitchhiker  0.000191986 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2719  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  51.51 
 
 
1176 aa  894  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0714  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  56.41 
 
 
1178 aa  730  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0122097  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0580  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.8 
 
 
1170 aa  721  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0311917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2781  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  57.09 
 
 
1363 aa  1565  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23930  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.55 
 
 
1162 aa  727  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268033  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0446  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  44.81 
 
 
1235 aa  796  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1108  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  50.18 
 
 
1279 aa  1270  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.10244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4338  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  57.3 
 
 
1160 aa  746  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0353  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  46.32 
 
 
1385 aa  1241  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.550494  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5116  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  57.84 
 
 
1155 aa  736  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0543  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  59.84 
 
 
1155 aa  763  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174564  normal  0.14479 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0753  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  57.32 
 
 
1170 aa  728  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2667  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  58.17 
 
 
1168 aa  740  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1958  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  48.48 
 
 
1173 aa  889  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>