129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0236 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0236  Resolvase domain protein  100 
 
 		 195 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000223632  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  94.87 
 
 		 195 aa  367  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  91.28 
 
 		 207 aa  354  5e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  67.54 
 
 		 197 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  67.54 
 
 		 202 aa  258  5.0000000000000005e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  51.6 
 
 		 229 aa  174  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  51.06 
 
 		 229 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  49.47 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  43.98 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  42.02 
 
 		 222 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  43.46 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  42.93 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  43.46 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  46.03 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  46.03 
 
 		 192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  43.92 
 
 		 193 aa  137  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0131  DNA binding domain protein, excisionase family  40.72 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000948008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0122  DNA binding domain protein, excisionase family  40.72 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0911  DNA binding domain protein, excisionase family  44.92 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000302589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  46.03 
 
 		 193 aa  135  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1190  DNA binding domain protein, excisionase family  40.21 
 
 		 216 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  40.62 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  40.62 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2574  DNA binding domain protein, excisionase family  43.85 
 
 		 194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  40.21 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  40 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  40.72 
 
 		 216 aa  131  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  39.69 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  39.8 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  38.54 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  44.39 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  39.39 
 
 		 219 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  40.21 
 
 		 244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1913  Resolvase domain protein  39.39 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  37.06 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  37.06 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1219  DNA binding domain protein, excisionase family  33.85 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2393  DNA binding domain protein, excisionase family  45.45 
 
 		 191 aa  122  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  34.38 
 
 		 215 aa  121  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  34.38 
 
 		 215 aa  121  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2194  Resolvase domain protein  38.18 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.72008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2000  DNA binding domain protein, excisionase family  37.95 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.27976  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3324  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296266  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  35.09 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3893  DNA binding domain protein, excisionase family  32.12 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3943  DNA binding domain protein, excisionase family  32.12 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000130893  normal  0.0337021 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  34.04 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0465  resolvase-like protein  35 
 
 		 219 aa  114  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0754  Resolvase domain protein  37.64 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1717  regulatory protein MerR  32.79 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.212526  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1220  DNA binding domain protein, excisionase family  28.65 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1270  Resolvase domain protein  33.16 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  39.55 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1304  transposon resolvase  33.7 
 
 		 209 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311544  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  36.88 
 
 		 194 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  39.55 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  37.86 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  34.62 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1218  resolvase domain protein  24.86 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1191  Resolvase domain protein  24.86 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2002  regulatory protein, MerR  34.23 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  32.98 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  37.12 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  32.28 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  32.98 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0842  resolvase domain-containing protein  34.34 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  35.07 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  31.35 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  31.35 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  35.2 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  33.81 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  34.65 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  31.25 
 
 		 475 aa  55.1  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  35.56 
 
 		 116 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2120  Resolvase domain protein  32.39 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 97 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 97 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  35.43 
 
 		 526 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11450  Resolvase domain protein  40.74 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000780792  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  24.3 
 
 		 271 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1238  Resolvase domain protein  30.99 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000100955  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  33.05 
 
 		 558 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  37.5 
 
 		 546 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1467  resolvase-like protein  32.69 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  35.04 
 
 		 476 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1891  transposase OrfA  37.29 
 
 		 74 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  29.69 
 
 		 544 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  31.78 
 
 		 569 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  34.31 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  33.33 
 
 		 532 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  32.81 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.21 
 
 		 274 aa  47  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  34.57 
 
 		 484 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0025  resolvase  36 
 
 		 511 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.712822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  34.57 
 
 		 484 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2258  resolvase domain-containing protein  37.29 
 
 		 74 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.216039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 128 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1074  resolvase, N- domain protein  70.97 
 
 		 58 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 96 aa  44.7  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>