More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2029 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  679    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  80.4 
 
 		 335 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  79.07 
 
 		 335 aa  503  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  78.74 
 
 		 335 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  75 
 
 		 330 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  71.99 
 
 		 358 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  70.39 
 
 		 331 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  69.06 
 
 		 330 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  62.5 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  53.89 
 
 		 328 aa  348  9e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  57 
 
 		 328 aa  345  8.999999999999999e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  55.37 
 
 		 328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  54.69 
 
 		 325 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  54.03 
 
 		 327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  51.55 
 
 		 328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  54.18 
 
 		 324 aa  335  7.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  55.81 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  53.58 
 
 		 325 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  50.78 
 
 		 324 aa  329  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  54.61 
 
 		 323 aa  325  9e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  48.5 
 
 		 325 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  51.33 
 
 		 324 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  51.48 
 
 		 328 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  51.45 
 
 		 329 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  51.45 
 
 		 329 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  49.17 
 
 		 327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  51.63 
 
 		 330 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  50.16 
 
 		 329 aa  305  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  51.75 
 
 		 328 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  50.16 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  46.51 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  45.97 
 
 		 331 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  45.64 
 
 		 331 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  46.64 
 
 		 331 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  44.04 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  45.68 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  43.67 
 
 		 337 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  43 
 
 		 324 aa  265  8e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  43.79 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.33 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  41.19 
 
 		 351 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.84 
 
 		 358 aa  252  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.65 
 
 		 326 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.4 
 
 		 330 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  43.14 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.58 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  44.04 
 
 		 334 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  42.19 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.04 
 
 		 324 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  43.29 
 
 		 323 aa  242  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  43.29 
 
 		 323 aa  242  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  41.04 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.99 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  41.74 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.2 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.28 
 
 		 323 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  41.67 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  40.94 
 
 		 323 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  42.9 
 
 		 310 aa  238  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.39 
 
 		 331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.94 
 
 		 335 aa  235  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.05 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.29 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  42.11 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.49 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.29 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.31 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.33 
 
 		 330 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.33 
 
 		 330 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.69 
 
 		 332 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.18 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  37.83 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.6 
 
 		 349 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  40.62 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  40.4 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.85 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.61 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  39.61 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.61 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.39 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  42.05 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  39.02 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  36.72 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  40.26 
 
 		 328 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.74 
 
 		 328 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.97 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  40.93 
 
 		 335 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  40.86 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  41.45 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  41.25 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.76 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  38.05 
 
 		 336 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  39.26 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  35.88 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.73 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  38.12 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  39.4 
 
 		 353 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  39.87 
 
 		 327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  39.88 
 
 		 330 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>