More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0454 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  99.7 
 
 		 329 aa  672    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  674    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  77.52 
 
 		 330 aa  512  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  74.77 
 
 		 328 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  68.39 
 
 		 329 aa  471  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  72.64 
 
 		 324 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  64.51 
 
 		 324 aa  445  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  69.18 
 
 		 323 aa  431  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  62.01 
 
 		 325 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  64.31 
 
 		 329 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  60.66 
 
 		 328 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  50.76 
 
 		 327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  52.72 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  51.29 
 
 		 330 aa  325  6e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  50.76 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  54.19 
 
 		 328 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  50.16 
 
 		 335 aa  319  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  51.77 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  52.12 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  48.48 
 
 		 328 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  50.16 
 
 		 328 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  50.99 
 
 		 331 aa  312  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  48.05 
 
 		 328 aa  311  7.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  51.49 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  48.9 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  49.67 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  49.67 
 
 		 335 aa  302  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  49.04 
 
 		 358 aa  298  8e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  48.71 
 
 		 324 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  44.55 
 
 		 324 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  42.16 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  38.82 
 
 		 332 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  39.07 
 
 		 331 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  39.07 
 
 		 331 aa  231  9e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.74 
 
 		 327 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  39.4 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  38.05 
 
 		 330 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  36.48 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  39.22 
 
 		 328 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  38.51 
 
 		 343 aa  215  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.39 
 
 		 328 aa  215  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.07 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.85 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.06 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  40.13 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  38.46 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  38.46 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  36.94 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  38.38 
 
 		 329 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.22 
 
 		 330 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.34 
 
 		 330 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  36.24 
 
 		 351 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.19 
 
 		 328 aa  208  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.24 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.21 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  38.22 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  35.94 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.99 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  37.17 
 
 		 343 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  37.27 
 
 		 324 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  37.24 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  37.34 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  37.82 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.3 
 
 		 314 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  37.04 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.7 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  34.67 
 
 		 327 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  37.93 
 
 		 698 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  37 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.72 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.68 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  36.02 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  34.72 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  37.81 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  38.54 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  36.72 
 
 		 341 aa  199  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  34.15 
 
 		 334 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  36.72 
 
 		 344 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  34.21 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  38.08 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  38.11 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  40 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  38.8 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  36.53 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  36.89 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  38.01 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.77 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36.16 
 
 		 325 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  36.71 
 
 		 345 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  37.5 
 
 		 333 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  36.71 
 
 		 345 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.16 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  37.54 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  37.66 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  36.5 
 
 		 322 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.64 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  36.68 
 
 		 332 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  36.67 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  36.69 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>