More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4597 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  660    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  64.78 
 
 
330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  46.08 
 
 
330 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  46.84 
 
 
331 aa  292  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  46.43 
 
 
358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  44.14 
 
 
330 aa  275  9e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  43.79 
 
 
335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  42.39 
 
 
334 aa  272  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  44.04 
 
 
335 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  43.67 
 
 
335 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  46.21 
 
 
332 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  46.92 
 
 
331 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  42.25 
 
 
328 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  46.23 
 
 
331 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  40.91 
 
 
328 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.09 
 
 
330 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.88 
 
 
326 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  46.58 
 
 
331 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.52 
 
 
324 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.61 
 
 
330 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  41.53 
 
 
327 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  41.53 
 
 
327 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  40.55 
 
 
326 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  41.96 
 
 
325 aa  245  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  40.65 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.8 
 
 
358 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.43 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  46.76 
 
 
324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  39.45 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.73 
 
 
330 aa  242  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.73 
 
 
330 aa  242  7e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.88 
 
 
328 aa  242  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 
398 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  41.9 
 
 
327 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.45 
 
 
344 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.09 
 
 
325 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.2 
 
 
327 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40 
 
 
323 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  42.38 
 
 
337 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  41.67 
 
 
325 aa  238  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.95 
 
 
328 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.98 
 
 
331 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.18 
 
 
324 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  41.18 
 
 
324 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.86 
 
 
349 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.98 
 
 
318 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  41.99 
 
 
325 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.39 
 
 
327 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  40.3 
 
 
334 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.25 
 
 
339 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  40.73 
 
 
326 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  42.18 
 
 
327 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.4 
 
 
328 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.75 
 
 
331 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.2 
 
 
322 aa  235  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  40.86 
 
 
328 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.33 
 
 
331 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  38.58 
 
 
330 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.54 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.1 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  41.75 
 
 
328 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.94 
 
 
328 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 
326 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.27 
 
 
327 aa  233  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.54 
 
 
328 aa  232  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  43.26 
 
 
328 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.94 
 
 
336 aa  232  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  39.93 
 
 
328 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.27 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.47 
 
 
324 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  38.72 
 
 
320 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  41.12 
 
 
327 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  41.33 
 
 
329 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  37.38 
 
 
321 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.89 
 
 
328 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.6 
 
 
356 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  39.21 
 
 
326 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  38.94 
 
 
323 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  40.66 
 
 
347 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.36 
 
 
330 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  38.82 
 
 
349 aa  228  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  38.54 
 
 
325 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.39 
 
 
336 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.94 
 
 
345 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  37.62 
 
 
332 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  36.2 
 
 
322 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  40.63 
 
 
351 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.94 
 
 
345 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.8 
 
 
333 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  39.14 
 
 
339 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.56 
 
 
328 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.8 
 
 
325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  40.46 
 
 
334 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.76 
 
 
327 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  36.96 
 
 
310 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  39.94 
 
 
322 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  40.52 
 
 
324 aa  225  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4341  extra-cytoplasmic solute receptor  42.63 
 
 
320 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40.26 
 
 
322 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  42.81 
 
 
332 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>