More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4341 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4341  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 320 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3819  hypothetical protein  88.29 
 
 		 318 aa  541  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  53.48 
 
 		 323 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  47.16 
 
 		 321 aa  286  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  44.55 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  46.39 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.08 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.97 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.3 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  47.84 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  41.64 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.67 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  45.03 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.16 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  43.32 
 
 		 339 aa  258  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.01 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.85 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  41.75 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  41.75 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.04 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  43.14 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.62 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  44.48 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  44.48 
 
 		 326 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  43.95 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.26 
 
 		 336 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  42.55 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  44.78 
 
 		 322 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  42.76 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  41.43 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  42 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.77 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  44.97 
 
 		 355 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  43.99 
 
 		 334 aa  248  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  41.28 
 
 		 332 aa  248  8e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  42.19 
 
 		 323 aa  248  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.49 
 
 		 344 aa  248  9e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  44.52 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  42 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  43.09 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.72 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  40.74 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.48 
 
 		 325 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  44.63 
 
 		 325 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.47 
 
 		 325 aa  245  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.19 
 
 		 324 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.47 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.72 
 
 		 356 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  46.26 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  42.14 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.33 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  42.54 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  41.61 
 
 		 329 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  39.88 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  44 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.82 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  44.3 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  41.08 
 
 		 332 aa  242  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  43.96 
 
 		 353 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.67 
 
 		 335 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.06 
 
 		 336 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  42.62 
 
 		 330 aa  242  7e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  42.62 
 
 		 330 aa  242  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.72 
 
 		 333 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.23 
 
 		 333 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  44.11 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  43.17 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.52 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  47.67 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  43.96 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  43.71 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  44.03 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  42.62 
 
 		 332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.86 
 
 		 332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  42.33 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  42.09 
 
 		 325 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.4 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.87 
 
 		 325 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  41.41 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  41.05 
 
 		 325 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  40.8 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  43.77 
 
 		 331 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.85 
 
 		 358 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.98 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.9 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  42.81 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  43.13 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.53 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.29 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  40.2 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  45.55 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 		 322 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  41.48 
 
 		 326 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  43.39 
 
 		 335 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  40.19 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  42.57 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  43.15 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>