More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3900 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 398 aa  810    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  62.71 
 
 		 330 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  62.5 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  58.97 
 
 		 330 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  62.67 
 
 		 331 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  61.18 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  62.38 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  61.06 
 
 		 335 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  61.79 
 
 		 335 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  57.76 
 
 		 324 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  56.23 
 
 		 328 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  57.48 
 
 		 328 aa  351  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  56.19 
 
 		 324 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  54.1 
 
 		 328 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  56.21 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  57.43 
 
 		 323 aa  342  5e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  52.34 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  51.96 
 
 		 325 aa  332  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  52.87 
 
 		 328 aa  332  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  54 
 
 		 328 aa  332  7.000000000000001e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  54.43 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  53.48 
 
 		 327 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  53.85 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  55 
 
 		 327 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  53 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  52.29 
 
 		 329 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  52.29 
 
 		 329 aa  319  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  51.15 
 
 		 329 aa  315  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  51.33 
 
 		 324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  46.67 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  49.33 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  46.8 
 
 		 331 aa  279  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  48.72 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  46.13 
 
 		 331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  43.77 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  46.8 
 
 		 331 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  42.16 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.64 
 
 		 331 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  45.27 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  40.25 
 
 		 323 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  42.38 
 
 		 315 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.33 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.23 
 
 		 331 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  40.68 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  42.18 
 
 		 351 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  42.2 
 
 		 335 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  40.52 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.12 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.98 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.57 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  40.2 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.19 
 
 		 326 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 		 328 aa  239  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.19 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.86 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.12 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.18 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40.32 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  41.28 
 
 		 323 aa  235  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  41.28 
 
 		 323 aa  235  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  43.52 
 
 		 331 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  39.12 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  41 
 
 		 322 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.2 
 
 		 353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.87 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.87 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3811  extra-cytoplasmic solute receptor  41.33 
 
 		 327 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.72 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.46 
 
 		 336 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  41.47 
 
 		 327 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  40.59 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41.53 
 
 		 338 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  37.38 
 
 		 327 aa  230  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  40.72 
 
 		 332 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  39.35 
 
 		 343 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.73 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.86 
 
 		 327 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  41.2 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.2 
 
 		 330 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  40.53 
 
 		 328 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.89 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  38.44 
 
 		 355 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.2 
 
 		 328 aa  226  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.2 
 
 		 328 aa  226  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  38.74 
 
 		 323 aa  226  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  41.28 
 
 		 334 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  41.53 
 
 		 386 aa  225  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.68 
 
 		 330 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  41.39 
 
 		 326 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.26 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.26 
 
 		 345 aa  225  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  41.82 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  38.08 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.31 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.69 
 
 		 328 aa  224  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>