More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1330 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  667    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  63.31 
 
 
325 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  60.98 
 
 
327 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  61.25 
 
 
325 aa  388  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  60.67 
 
 
327 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  54.75 
 
 
330 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  55.33 
 
 
331 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  58.54 
 
 
324 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  55.38 
 
 
324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  57.48 
 
 
398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  53.37 
 
 
330 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  54.97 
 
 
334 aa  355  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  56.07 
 
 
324 aa  354  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  52.94 
 
 
335 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  53.82 
 
 
335 aa  347  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  54.34 
 
 
325 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  52.6 
 
 
358 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  56.13 
 
 
329 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  58.09 
 
 
323 aa  341  8e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  55.37 
 
 
330 aa  341  9e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  55.21 
 
 
328 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  52.49 
 
 
335 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  50 
 
 
328 aa  339  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  54.05 
 
 
329 aa  333  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  54.05 
 
 
329 aa  333  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  51.98 
 
 
328 aa  333  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  52.61 
 
 
328 aa  332  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  49.67 
 
 
328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  52.6 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  47.67 
 
 
327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  47.47 
 
 
331 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  45.3 
 
 
332 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  46.8 
 
 
331 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  48.57 
 
 
328 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  44.44 
 
 
324 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  47.04 
 
 
328 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  48.82 
 
 
323 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  48.82 
 
 
323 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  47.47 
 
 
331 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  44.03 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  43.33 
 
 
351 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  44.13 
 
 
337 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.11 
 
 
331 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  42.02 
 
 
315 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.66 
 
 
327 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  41.53 
 
 
330 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  42.19 
 
 
337 aa  249  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  43.97 
 
 
335 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.19 
 
 
328 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  38.96 
 
 
343 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  41.67 
 
 
322 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  42.63 
 
 
322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.52 
 
 
330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.93 
 
 
330 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  41.25 
 
 
328 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  41.75 
 
 
335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  42.95 
 
 
330 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  42.19 
 
 
331 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  42.27 
 
 
334 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.93 
 
 
330 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.24 
 
 
333 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  41.12 
 
 
329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.55 
 
 
328 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  41.25 
 
 
334 aa  238  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  42.24 
 
 
332 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  38.48 
 
 
334 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.53 
 
 
324 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  37.2 
 
 
336 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  40.98 
 
 
327 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.66 
 
 
336 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.18 
 
 
314 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  39.88 
 
 
330 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.34 
 
 
330 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.86 
 
 
331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.85 
 
 
327 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  39.08 
 
 
330 aa  235  8e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.86 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.37 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.68 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.87 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.87 
 
 
330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  39.55 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.7 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.7 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  39.74 
 
 
335 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.66 
 
 
328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  43.71 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.06 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.03 
 
 
323 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.53 
 
 
353 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  42.77 
 
 
330 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.62 
 
 
345 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.53 
 
 
339 aa  231  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.62 
 
 
345 aa  231  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38.33 
 
 
325 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.47 
 
 
339 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.25 
 
 
335 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.98 
 
 
358 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  39.62 
 
 
322 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.88077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>