More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3356 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  72.45 
 
 		 328 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  64.29 
 
 		 331 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  64.29 
 
 		 331 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  64.43 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  62.33 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  58.95 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  62.33 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  60.88 
 
 		 315 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  60.64 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  57.19 
 
 		 351 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  60.14 
 
 		 323 aa  346  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  60.14 
 
 		 323 aa  346  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3851  hypothetical protein  49.38 
 
 		 352 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  45.72 
 
 		 330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  49.16 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  44.51 
 
 		 330 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  46.73 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  48.11 
 
 		 324 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  48.42 
 
 		 327 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  48.49 
 
 		 325 aa  276  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  46.82 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  43.75 
 
 		 335 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  45.61 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  45.27 
 
 		 398 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  43.33 
 
 		 335 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  43 
 
 		 335 aa  265  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  45.92 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  47.3 
 
 		 327 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  46.15 
 
 		 325 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  43.77 
 
 		 334 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  43.88 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  42 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  41.36 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  42.47 
 
 		 329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  41.4 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  40.76 
 
 		 330 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  41.42 
 
 		 325 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.39 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  41.4 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  39.53 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.14 
 
 		 339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  41.31 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.19 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  43 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  40.59 
 
 		 324 aa  232  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.74 
 
 		 330 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  41.89 
 
 		 330 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  39.2 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  38.78 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.46 
 
 		 330 aa  228  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  39.06 
 
 		 330 aa  225  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  40.62 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  42.19 
 
 		 329 aa  225  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.21 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.94 
 
 		 326 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  39.44 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.91 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  38.39 
 
 		 698 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  39.53 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 		 331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  39.51 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.19 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  38.31 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.07 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  38.36 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  38.36 
 
 		 329 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.91 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.38 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  37.41 
 
 		 339 aa  215  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38 
 
 		 325 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  36.63 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  36.42 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  37.5 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  35.24 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.69 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.22 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.16 
 
 		 328 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  37.58 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  38.38 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  39.37 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.51 
 
 		 325 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.76 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.07 
 
 		 324 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0012  hypothetical protein  36.7 
 
 		 323 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  36.1 
 
 		 341 aa  209  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  36.82 
 
 		 337 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.39 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  37.97 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.39 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.09 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  37.5 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  37.46 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  37.46 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38.44 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.04 
 
 		 327 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  38.83 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.67 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.26 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.29 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>