More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3883 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  655    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  50.17 
 
 
324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  49.67 
 
 
325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  48.69 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  47.52 
 
 
324 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  50.17 
 
 
323 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  46.38 
 
 
328 aa  295  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  46.33 
 
 
329 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  43.89 
 
 
330 aa  285  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  44.66 
 
 
329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  44.66 
 
 
329 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  44.65 
 
 
328 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  43.93 
 
 
331 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  45.02 
 
 
328 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  45.13 
 
 
329 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  43.89 
 
 
328 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  44.48 
 
 
358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  44.44 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  43.23 
 
 
334 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  43.56 
 
 
335 aa  262  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  40.67 
 
 
330 aa  259  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  43.23 
 
 
335 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  42.72 
 
 
335 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  42.16 
 
 
398 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  40.33 
 
 
328 aa  251  9.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  42.86 
 
 
325 aa  248  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  41.99 
 
 
325 aa  245  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  42.81 
 
 
327 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  42.72 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  42.38 
 
 
324 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  41.72 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  38.83 
 
 
329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.98 
 
 
330 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.98 
 
 
330 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.74 
 
 
331 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  39.67 
 
 
331 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  39.33 
 
 
331 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  40.85 
 
 
328 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.87 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.51 
 
 
331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  39.67 
 
 
331 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  36.42 
 
 
332 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  37.46 
 
 
330 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38.49 
 
 
325 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  35.56 
 
 
323 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  38.82 
 
 
337 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.94 
 
 
327 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.72 
 
 
328 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  37.5 
 
 
343 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  36.63 
 
 
334 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.61 
 
 
328 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.14 
 
 
330 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  36.94 
 
 
334 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  35.64 
 
 
334 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.33 
 
 
339 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  38.54 
 
 
338 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.76 
 
 
328 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  38.36 
 
 
349 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  35.02 
 
 
335 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.82 
 
 
336 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  38.94 
 
 
331 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  41.64 
 
 
328 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  36.51 
 
 
336 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  34.44 
 
 
328 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.7 
 
 
326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  38.13 
 
 
335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.22 
 
 
334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  34.44 
 
 
328 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  35.76 
 
 
322 aa  199  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  35.76 
 
 
332 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36.03 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  34.94 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  36.45 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.03 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  36.36 
 
 
304 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  36.52 
 
 
351 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.03 
 
 
327 aa  195  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  35.74 
 
 
321 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  34.98 
 
 
324 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  37.29 
 
 
332 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  37 
 
 
324 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  35 
 
 
328 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  39.07 
 
 
335 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  36.11 
 
 
358 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2040  hypothetical protein  38.94 
 
 
332 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  37.58 
 
 
324 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  38.36 
 
 
327 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  36.54 
 
 
341 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  38.28 
 
 
336 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  34.77 
 
 
339 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  37.05 
 
 
337 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  33.86 
 
 
323 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  36.16 
 
 
325 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  36 
 
 
324 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  35.64 
 
 
337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  33.01 
 
 
327 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  38.31 
 
 
322 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  36.62 
 
 
329 aa  188  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  38.28 
 
 
331 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  36.45 
 
 
310 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>