More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0780 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  672    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  80.13 
 
 
328 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  80.46 
 
 
324 aa  515  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  77.52 
 
 
329 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  77.52 
 
 
329 aa  514  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  70.61 
 
 
329 aa  485  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  66.56 
 
 
324 aa  460  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  69.44 
 
 
323 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  64.72 
 
 
325 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  65.59 
 
 
329 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  63.5 
 
 
328 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  55.81 
 
 
398 aa  345  5e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  54.07 
 
 
330 aa  342  7e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  52.28 
 
 
330 aa  337  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  52.13 
 
 
331 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  54.98 
 
 
328 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  51.54 
 
 
328 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  53.53 
 
 
358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  49.09 
 
 
328 aa  324  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  49.53 
 
 
328 aa  319  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  49.38 
 
 
327 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  50 
 
 
335 aa  315  7e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  49.7 
 
 
325 aa  315  9e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  50 
 
 
325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  49.84 
 
 
327 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  48.69 
 
 
324 aa  305  7e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  51.82 
 
 
334 aa  305  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  50 
 
 
335 aa  302  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  49.01 
 
 
335 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  48.33 
 
 
324 aa  292  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  43.93 
 
 
327 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  39.87 
 
 
332 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  41.03 
 
 
327 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.09 
 
 
328 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  40.27 
 
 
331 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  39.93 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.53 
 
 
328 aa  232  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.53 
 
 
328 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  38.87 
 
 
323 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.45 
 
 
331 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  39.19 
 
 
323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  39.19 
 
 
323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  40.74 
 
 
328 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  40.27 
 
 
331 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.43 
 
 
339 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.4 
 
 
338 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  39.49 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  38.85 
 
 
343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  37.83 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.94 
 
 
330 aa  219  6e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.94 
 
 
330 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  41.75 
 
 
328 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  39.54 
 
 
322 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  38.46 
 
 
330 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.62 
 
 
336 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.76 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  37.41 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.56 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  39.79 
 
 
329 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  37.06 
 
 
334 aa  212  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  37.87 
 
 
343 aa  212  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.03 
 
 
330 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  38.49 
 
 
325 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  40.67 
 
 
326 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.08 
 
 
326 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  37.42 
 
 
335 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  36.22 
 
 
327 aa  209  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.36 
 
 
332 aa  208  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.91 
 
 
358 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 
322 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  39.06 
 
 
328 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  36.89 
 
 
329 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.57 
 
 
328 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  35.86 
 
 
324 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  39.55 
 
 
335 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  38.36 
 
 
332 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  38.07 
 
 
322 aa  205  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  35.21 
 
 
334 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  35.85 
 
 
331 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  38.74 
 
 
353 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  37.85 
 
 
320 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  39.87 
 
 
330 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  37.7 
 
 
325 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  37.19 
 
 
335 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  37.54 
 
 
339 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  39.09 
 
 
325 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  41.18 
 
 
335 aa  202  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  35.33 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.03 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  38.21 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  38.14 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.13 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  39.88 
 
 
698 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.81 
 
 
327 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  35.09 
 
 
327 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  37.5 
 
 
332 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  35.44 
 
 
328 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  38.41 
 
 
355 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.46 
 
 
324 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.17 
 
 
331 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>