More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1320 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  640    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  70.17 
 
 
331 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  69.26 
 
 
332 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  69.49 
 
 
331 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  70.17 
 
 
331 aa  414  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  58.28 
 
 
328 aa  342  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  60.33 
 
 
328 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  53.07 
 
 
315 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  52.36 
 
 
351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  47.4 
 
 
337 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  49.67 
 
 
325 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  49.84 
 
 
327 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  48.57 
 
 
325 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  49.83 
 
 
327 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  49.02 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  48.68 
 
 
328 aa  282  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3851  hypothetical protein  47.95 
 
 
352 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  42.67 
 
 
330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  44.55 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  45.14 
 
 
323 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  46.45 
 
 
335 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  45.15 
 
 
335 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  46.84 
 
 
324 aa  270  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  42.9 
 
 
330 aa  269  4e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  44.11 
 
 
335 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  43.24 
 
 
331 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  42.57 
 
 
358 aa  262  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  43.58 
 
 
327 aa  262  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  43.56 
 
 
328 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  43.29 
 
 
334 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  40.75 
 
 
324 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  41.39 
 
 
398 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  42.41 
 
 
325 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  44.41 
 
 
337 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  41.58 
 
 
328 aa  248  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  40 
 
 
324 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  40 
 
 
328 aa  245  6e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  44.15 
 
 
323 aa  245  8e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  43.58 
 
 
330 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  44.41 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  39.19 
 
 
330 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  44.16 
 
 
330 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  43.69 
 
 
329 aa  229  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  42.37 
 
 
330 aa  229  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  38.96 
 
 
328 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  39.69 
 
 
329 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.28 
 
 
336 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  37.38 
 
 
329 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  37.38 
 
 
329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  36.51 
 
 
329 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  40.75 
 
 
330 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.33 
 
 
331 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  38.64 
 
 
328 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  39.02 
 
 
329 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  40.8 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.61 
 
 
330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  37.42 
 
 
339 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  40.72 
 
 
334 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  40.54 
 
 
337 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  40 
 
 
341 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  41.22 
 
 
321 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.46 
 
 
327 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  38.54 
 
 
322 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  39.37 
 
 
320 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.26 
 
 
330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.28 
 
 
328 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  42.76 
 
 
328 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.45 
 
 
327 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.28 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  37.34 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  38.64 
 
 
698 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.84 
 
 
351 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.45 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3811  extra-cytoplasmic solute receptor  41.33 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  39.66 
 
 
334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  38.73 
 
 
341 aa  212  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  39.4 
 
 
335 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  37.34 
 
 
345 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  38.38 
 
 
325 aa  212  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  38.87 
 
 
328 aa  212  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  38.38 
 
 
325 aa  211  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.78 
 
 
339 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  37.34 
 
 
345 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  39.93 
 
 
334 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  38.92 
 
 
322 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.38 
 
 
343 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  38.46 
 
 
331 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  40.13 
 
 
334 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  38.41 
 
 
320 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.64 
 
 
334 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.79 
 
 
325 aa  209  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.22 
 
 
360 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  43.28 
 
 
328 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.05 
 
 
335 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  39.02 
 
 
331 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  40.8 
 
 
334 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  36.88 
 
 
330 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  39.32 
 
 
317 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.09 
 
 
333 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>