More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3797 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  61.59 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  60.06 
 
 		 351 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  60.55 
 
 		 331 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  60.21 
 
 		 331 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  60.9 
 
 		 331 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  60.97 
 
 		 328 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  56.81 
 
 		 337 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  60.88 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  60.27 
 
 		 334 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3851  hypothetical protein  59.73 
 
 		 352 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  56.29 
 
 		 335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  53.72 
 
 		 323 aa  315  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  53.72 
 
 		 323 aa  315  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  43.85 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  40.84 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  42.38 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  41.67 
 
 		 358 aa  245  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  41.86 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  42.81 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  39.2 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  41.02 
 
 		 327 aa  238  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  40.2 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  42.77 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  41.87 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  40.39 
 
 		 327 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  37.93 
 
 		 335 aa  228  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  39.53 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  39.73 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  42.96 
 
 		 328 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  37.93 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  37.83 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  36.55 
 
 		 335 aa  222  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  37.38 
 
 		 325 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  39.18 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  37.21 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  38.13 
 
 		 330 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  39.67 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  38.54 
 
 		 324 aa  212  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.47 
 
 		 339 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.41 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  41.81 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  35.06 
 
 		 328 aa  208  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  38.03 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  37.88 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  38.67 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.54 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  35.64 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  38.31 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  34.87 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  38.8 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  36.77 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  35.2 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  38.78 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.25 
 
 		 330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  37.29 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  38.06 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  35.31 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  37.67 
 
 		 337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  34.83 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  33.86 
 
 		 333 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  38.05 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  37.79 
 
 		 335 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  35.4 
 
 		 328 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3811  extra-cytoplasmic solute receptor  36.95 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  36.68 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  36.01 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  36.84 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  35.14 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  38.21 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.45 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  38.83 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.02 
 
 		 328 aa  196  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  35.05 
 
 		 328 aa  195  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.38 
 
 		 328 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  36.95 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  34.44 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  34.43 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  35.16 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  36.98 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  37.37 
 
 		 335 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  36.15 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  36.79 
 
 		 333 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  35.87 
 
 		 344 aa  192  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  35.93 
 
 		 327 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  37.14 
 
 		 326 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  36.58 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.81 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  36.21 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  34.83 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  36.58 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  34.44 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  35.74 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  34.24 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  35.06 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  35.08 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  35.33 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  33.89 
 
 		 358 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  35.45 
 
 		 331 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  35.93 
 
 		 328 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>