More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4104 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  662    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  86.85 
 
 		 327 aa  557  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  86.56 
 
 		 325 aa  551  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  85.93 
 
 		 327 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  76.18 
 
 		 324 aa  487  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  63.31 
 
 		 328 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  54.55 
 
 		 330 aa  374  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  56.31 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  55.37 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  54 
 
 		 331 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  53.7 
 
 		 330 aa  362  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  54.57 
 
 		 328 aa  362  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  54.79 
 
 		 335 aa  360  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  60.07 
 
 		 323 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  55.48 
 
 		 334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  53.27 
 
 		 358 aa  350  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  54.15 
 
 		 335 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  52.61 
 
 		 328 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  52.5 
 
 		 328 aa  345  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  53.07 
 
 		 329 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  52.75 
 
 		 329 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  52.79 
 
 		 324 aa  339  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  53 
 
 		 398 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  51.68 
 
 		 328 aa  335  9e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  53.23 
 
 		 329 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  52.29 
 
 		 328 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  50 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  50.16 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  48.58 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  48.67 
 
 		 327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  50.17 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  50.51 
 
 		 331 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  50.17 
 
 		 331 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  50.51 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  49.83 
 
 		 323 aa  286  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  49.83 
 
 		 323 aa  286  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  47.76 
 
 		 328 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  44.44 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  42.62 
 
 		 323 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  42.86 
 
 		 324 aa  266  5e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  43.08 
 
 		 337 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  45.66 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  42.81 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  41.44 
 
 		 329 aa  248  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  43.93 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  42.19 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.64 
 
 		 331 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.31 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  43.52 
 
 		 328 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  39.18 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  41.58 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  40.92 
 
 		 334 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.38 
 
 		 336 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  42.57 
 
 		 330 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.86 
 
 		 331 aa  235  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  39.37 
 
 		 343 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.93 
 
 		 330 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40 
 
 		 335 aa  231  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  41.97 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  40.41 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.72 
 
 		 349 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.12 
 
 		 327 aa  229  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  39 
 
 		 334 aa  228  8e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.17 
 
 		 331 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  41.06 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  36.42 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  37.75 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  39.38 
 
 		 353 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.53 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.54 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.54 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  38.74 
 
 		 343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.94 
 
 		 325 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.99 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  43.05 
 
 		 330 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.49 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  40.8 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  39.25 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.5 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  40.2 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.04 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.95 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  38.41 
 
 		 698 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.28 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.67 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  39.19 
 
 		 333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.03 
 
 		 328 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.03 
 
 		 328 aa  221  9e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  39.87 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38.21 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.2 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.48 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.4 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  39.4 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  40.2 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  39.27 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  38.34 
 
 		 345 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  38.34 
 
 		 345 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.7 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.7 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>