More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0709 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  671    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  62.87 
 
 
328 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  60 
 
 
328 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  57.48 
 
 
330 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  58.05 
 
 
358 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  57.1 
 
 
331 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  55.79 
 
 
330 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  55.85 
 
 
335 aa  347  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  56.19 
 
 
335 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  55.85 
 
 
334 aa  345  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  53.62 
 
 
324 aa  342  7e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  50.31 
 
 
324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  53.44 
 
 
398 aa  335  7.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  53.85 
 
 
335 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  53.27 
 
 
325 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  52.46 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  50.97 
 
 
329 aa  326  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  53.44 
 
 
323 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  51.88 
 
 
327 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  51.48 
 
 
330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  50.93 
 
 
325 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  53.25 
 
 
328 aa  318  6e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  52.01 
 
 
327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  48.58 
 
 
324 aa  312  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  49.83 
 
 
329 aa  309  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  49.35 
 
 
325 aa  309  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  49.83 
 
 
329 aa  309  5e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  47.37 
 
 
328 aa  308  6.999999999999999e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  48.05 
 
 
329 aa  305  9.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  42.52 
 
 
327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  40.33 
 
 
324 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  41.69 
 
 
331 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  41.36 
 
 
331 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  40.94 
 
 
330 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  40.34 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  40.67 
 
 
329 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  41.69 
 
 
331 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  39.18 
 
 
328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  41.3 
 
 
323 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  41.3 
 
 
323 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.43 
 
 
332 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  37.5 
 
 
323 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.47 
 
 
328 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.56 
 
 
327 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  38.8 
 
 
331 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  38.18 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  38.29 
 
 
323 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.8 
 
 
326 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.93 
 
 
331 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.07 
 
 
324 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  36.5 
 
 
326 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4844  hypothetical protein  38.59 
 
 
322 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  37.92 
 
 
336 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.46 
 
 
330 aa  215  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.85 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.92 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.05 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.29 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  37.75 
 
 
328 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  35.91 
 
 
337 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.37 
 
 
349 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.74 
 
 
328 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  38.66 
 
 
328 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  36.36 
 
 
326 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  35.4 
 
 
343 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  37.12 
 
 
338 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  35.24 
 
 
314 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.61 
 
 
327 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  35.06 
 
 
315 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  36.76 
 
 
327 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  36.27 
 
 
328 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  39.47 
 
 
324 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36.27 
 
 
328 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  34.98 
 
 
331 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3811  extra-cytoplasmic solute receptor  35.15 
 
 
327 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.28 
 
 
331 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  36.39 
 
 
358 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  34.97 
 
 
343 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.5 
 
 
330 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.5 
 
 
330 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  38.94 
 
 
330 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.42 
 
 
328 aa  205  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  37.25 
 
 
337 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  35.93 
 
 
334 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36.12 
 
 
339 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  37 
 
 
334 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  37.83 
 
 
327 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  35.71 
 
 
322 aa  203  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  36.92 
 
 
333 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.17 
 
 
334 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  35.98 
 
 
337 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  36.36 
 
 
343 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  37.67 
 
 
324 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  34.86 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.45 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  38.49 
 
 
321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  35.08 
 
 
322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.83 
 
 
327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  35.42 
 
 
318 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  35.02 
 
 
323 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>