More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6193 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  644    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  77.33 
 
 		 337 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  50 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  47.47 
 
 		 332 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  47.47 
 
 		 331 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  47.47 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  45.62 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  44.55 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  41.5 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  47.81 
 
 		 331 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  42.6 
 
 		 324 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  41.88 
 
 		 358 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  42.52 
 
 		 351 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  41.32 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  41.5 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  43.79 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  43.44 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  42.03 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  40.37 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  39.34 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  42.26 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  42.02 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  42.37 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  43.35 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  43.6 
 
 		 335 aa  229  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  44.41 
 
 		 323 aa  229  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  44.41 
 
 		 323 aa  229  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  40.39 
 
 		 398 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  41.75 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  42.33 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  42.33 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  43.84 
 
 		 335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  43.09 
 
 		 334 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  45.86 
 
 		 349 aa  225  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  42.96 
 
 		 315 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  41.5 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  40.07 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  40.41 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  40.55 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.4 
 
 		 330 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  41.58 
 
 		 327 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  41 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.02 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  43.21 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  39.94 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  37.99 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  41.27 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  43.23 
 
 		 330 aa  219  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  39.35 
 
 		 329 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  44.16 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  41.75 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  39.35 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  40 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.61 
 
 		 330 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.88 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.67 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.87 
 
 		 327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  40.85 
 
 		 324 aa  215  9e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  37.11 
 
 		 328 aa  215  9e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.06 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.8 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  38.76 
 
 		 328 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  38.78 
 
 		 331 aa  212  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  38.1 
 
 		 330 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  40.69 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  40.14 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.11 
 
 		 336 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.2 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  41.45 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  40.07 
 
 		 335 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.97 
 
 		 327 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.14 
 
 		 330 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  39.06 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  39.3 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  43.38 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.54 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  39.94 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  40.6 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.54 
 
 		 322 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.73 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  42.56 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.2 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  38.15 
 
 		 344 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  41.35 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  41.18 
 
 		 331 aa  205  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0012  hypothetical protein  41.26 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.72 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  39.85 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.54 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  37.87 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.82 
 
 		 327 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.61 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3851  hypothetical protein  39.46 
 
 		 352 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  36.77 
 
 		 329 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  41.54 
 
 		 334 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  41.3 
 
 		 337 aa  202  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  37.54 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  39.67 
 
 		 698 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  38.49 
 
 		 330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  37.15 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>