More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3851 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3851  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  704    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  61.93 
 
 		 351 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  59.73 
 
 		 315 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  53.1 
 
 		 332 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  51.02 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  50.68 
 
 		 331 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  52.41 
 
 		 337 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  51.02 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  49.84 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  54.67 
 
 		 334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  49.38 
 
 		 328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  49.29 
 
 		 335 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  49.66 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  49.66 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  39.13 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  40.6 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  41.81 
 
 		 328 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  38.89 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  39.94 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  38.63 
 
 		 330 aa  229  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  39.07 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  40.54 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  40.45 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  38.93 
 
 		 329 aa  218  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  40.96 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  35.12 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  35.12 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  39.17 
 
 		 335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  40.69 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  38.19 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  39.79 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.86 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.21 
 
 		 339 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.86 
 
 		 345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  40.48 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  36.45 
 
 		 334 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  37.54 
 
 		 339 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  37.54 
 
 		 341 aa  212  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  38.06 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.58 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  38.06 
 
 		 327 aa  210  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  33.78 
 
 		 335 aa  209  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  38.46 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  37.93 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.25 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  37.68 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.17 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  36.91 
 
 		 324 aa  206  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  35.64 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.64 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  35.91 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  36.89 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.39 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  36.62 
 
 		 698 aa  204  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  40.78 
 
 		 343 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  36.12 
 
 		 328 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  35.58 
 
 		 343 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  34.88 
 
 		 325 aa  202  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  35.25 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.98 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  38.1 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  36.05 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  34.5 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.48 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  38.78 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.19 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  37.58 
 
 		 329 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  35.14 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  37.2 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  36.45 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  33.13 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  35.93 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  34.56 
 
 		 326 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  36.42 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  34.98 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  35.83 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  34.98 
 
 		 328 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  34.41 
 
 		 325 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  36.82 
 
 		 327 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  36.02 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  40.07 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  36.48 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  35.86 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  36.67 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.59 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  35.08 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  36.27 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  34.5 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  32.33 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  37.16 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  35.74 
 
 		 349 aa  193  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  36.58 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  34.69 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  35.91 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  37.79 
 
 		 333 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.05 
 
 		 331 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  34.21 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  34.83 
 
 		 330 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  35.31 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  36.75 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>