More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3459 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  96.94 
 
 
327 aa  617  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  82.77 
 
 
325 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  86.73 
 
 
325 aa  534  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  74.53 
 
 
324 aa  471  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  62.01 
 
 
328 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  53.94 
 
 
330 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  55.25 
 
 
324 aa  363  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  54.1 
 
 
330 aa  362  4e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  56.49 
 
 
328 aa  362  6e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  55.88 
 
 
335 aa  361  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  55.12 
 
 
335 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  53.67 
 
 
331 aa  351  8e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  55.81 
 
 
334 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  53.59 
 
 
358 aa  346  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  52.94 
 
 
328 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  57.76 
 
 
323 aa  341  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  53.82 
 
 
335 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  52.75 
 
 
329 aa  339  5e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  55 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  52.43 
 
 
329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  51.56 
 
 
328 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  50.61 
 
 
328 aa  335  5.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  51.26 
 
 
325 aa  335  7.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  52.34 
 
 
328 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  51.48 
 
 
324 aa  332  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  53.55 
 
 
329 aa  332  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  49.24 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  49.84 
 
 
330 aa  322  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  47 
 
 
327 aa  301  9e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  49.83 
 
 
332 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  49.16 
 
 
331 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  48.82 
 
 
331 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  49.83 
 
 
323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  49.83 
 
 
323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  49.16 
 
 
331 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  43.93 
 
 
323 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  46.84 
 
 
328 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  42.48 
 
 
324 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  44.89 
 
 
328 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  42.28 
 
 
337 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  44.29 
 
 
351 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  42.12 
 
 
329 aa  249  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.85 
 
 
328 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  41.47 
 
 
315 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  42.91 
 
 
335 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.74 
 
 
336 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  39.75 
 
 
337 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  41.58 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.34 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  42.19 
 
 
331 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.46 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.69 
 
 
331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.09 
 
 
331 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  40.12 
 
 
334 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.61 
 
 
330 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  38.75 
 
 
334 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  40.92 
 
 
334 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  41.36 
 
 
330 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.06 
 
 
343 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.07 
 
 
349 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.48 
 
 
327 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.92 
 
 
327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.72 
 
 
328 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.92 
 
 
331 aa  225  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.87 
 
 
339 aa  225  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.92 
 
 
331 aa  225  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.46 
 
 
327 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  38.66 
 
 
331 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.39 
 
 
328 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  40.88 
 
 
330 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.47 
 
 
327 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  39.07 
 
 
324 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.09 
 
 
330 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  40.27 
 
 
327 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  41.12 
 
 
331 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  37.42 
 
 
321 aa  221  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.53 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  39.4 
 
 
310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.82 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.2 
 
 
353 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.58 
 
 
328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.25 
 
 
328 aa  219  6e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  37.7 
 
 
335 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  41.01 
 
 
330 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  38.66 
 
 
345 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.67 
 
 
322 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.54 
 
 
330 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.27 
 
 
326 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  38.66 
 
 
345 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.54 
 
 
330 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  38.73 
 
 
323 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  37.5 
 
 
320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.67 
 
 
325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  39.67 
 
 
325 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  39.87 
 
 
355 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  40.13 
 
 
330 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  36.67 
 
 
334 aa  215  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.81 
 
 
339 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.27 
 
 
339 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>