More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3614 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  668    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  88.75 
 
 
328 aa  598  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  64.74 
 
 
324 aa  437  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  65.59 
 
 
330 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  67.54 
 
 
323 aa  408  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  64.54 
 
 
329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  63.23 
 
 
324 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  64.22 
 
 
329 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  62.7 
 
 
328 aa  398  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  59.74 
 
 
329 aa  381  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  57.67 
 
 
325 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  51.76 
 
 
328 aa  335  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  50.61 
 
 
328 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  55.31 
 
 
328 aa  332  7.000000000000001e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  54.43 
 
 
398 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  50.8 
 
 
330 aa  325  7e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  52.71 
 
 
327 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  53.18 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  51.3 
 
 
331 aa  316  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  53.55 
 
 
327 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  51.37 
 
 
325 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  50.8 
 
 
358 aa  311  6.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  46.77 
 
 
328 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  47.84 
 
 
330 aa  298  7e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  50.16 
 
 
334 aa  298  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  49.7 
 
 
324 aa  296  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  46.18 
 
 
335 aa  290  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  48.04 
 
 
335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  46.13 
 
 
335 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  44.44 
 
 
324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  43.51 
 
 
327 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  43.9 
 
 
328 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  39.53 
 
 
332 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  40.2 
 
 
331 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  40.2 
 
 
331 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  39.14 
 
 
323 aa  222  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  38.39 
 
 
337 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  39.1 
 
 
335 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  40.53 
 
 
331 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  39.81 
 
 
315 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  39.73 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  39.3 
 
 
328 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  39.66 
 
 
351 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  39.02 
 
 
323 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  39.02 
 
 
323 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  42.05 
 
 
329 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  41.16 
 
 
328 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.31 
 
 
327 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.42 
 
 
330 aa  202  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.97 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.23 
 
 
330 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.87 
 
 
339 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  37.46 
 
 
336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.38 
 
 
331 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.03 
 
 
330 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.12 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  37.62 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  37.25 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  38.85 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  37.19 
 
 
343 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  37.99 
 
 
338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.02 
 
 
326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.87 
 
 
328 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.25 
 
 
336 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  39.52 
 
 
323 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  35.46 
 
 
328 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  35.46 
 
 
328 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.23 
 
 
328 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  40.14 
 
 
327 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  37.86 
 
 
327 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  41.34 
 
 
335 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.88 
 
 
325 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.88 
 
 
327 aa  193  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.19 
 
 
328 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.74 
 
 
333 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  36.99 
 
 
343 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  37 
 
 
331 aa  192  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.54 
 
 
322 aa  192  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.57 
 
 
328 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.82 
 
 
328 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.34 
 
 
314 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  37.13 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  37.05 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.76 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  37.18 
 
 
334 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  37.58 
 
 
698 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  38.89 
 
 
334 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  37.42 
 
 
320 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  36.83 
 
 
325 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.89 
 
 
330 aa  188  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.89 
 
 
330 aa  188  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  37.7 
 
 
325 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.78 
 
 
331 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  39.12 
 
 
333 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.31 
 
 
327 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  36.39 
 
 
323 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  38.51 
 
 
337 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  36.31 
 
 
335 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  37.17 
 
 
331 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  36.56 
 
 
326 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>