More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0579 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  671    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  83.33 
 
 		 331 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  79 
 
 		 358 aa  511  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  75.42 
 
 		 334 aa  491  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  73.29 
 
 		 330 aa  488  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  70.59 
 
 		 335 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  72.43 
 
 		 335 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  71.1 
 
 		 335 aa  461  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  62.71 
 
 		 398 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  55.9 
 
 		 328 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  56.21 
 
 		 328 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  55.03 
 
 		 324 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  53.05 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  54.63 
 
 		 325 aa  360  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  54.66 
 
 		 327 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  56.72 
 
 		 324 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  54.21 
 
 		 325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  54.75 
 
 		 328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  54.3 
 
 		 327 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  52.94 
 
 		 324 aa  346  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  53 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  53.9 
 
 		 330 aa  342  7e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  54.79 
 
 		 323 aa  341  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  53.27 
 
 		 328 aa  338  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  51.3 
 
 		 329 aa  325  9e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  51.3 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  50.97 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  49.7 
 
 		 328 aa  322  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  49.33 
 
 		 327 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  49.68 
 
 		 329 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  46.64 
 
 		 332 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  45.85 
 
 		 329 aa  292  5e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  43.89 
 
 		 324 aa  286  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  44.78 
 
 		 331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  48.81 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  44.11 
 
 		 331 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  44.78 
 
 		 331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.11 
 
 		 326 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  42.52 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.02 
 
 		 327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  40.38 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  42.52 
 
 		 330 aa  265  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  42.36 
 
 		 337 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.83 
 
 		 358 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  46.18 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  45.54 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  46.18 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.67 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  42.91 
 
 		 323 aa  258  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  42.91 
 
 		 323 aa  258  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  43.85 
 
 		 331 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.16 
 
 		 330 aa  258  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  42.54 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.24 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.19 
 
 		 331 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.87 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  40.49 
 
 		 328 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  41.8 
 
 		 323 aa  252  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.67 
 
 		 331 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.33 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  40.84 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.85 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.09 
 
 		 349 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  44.26 
 
 		 328 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.24 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.02 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.34 
 
 		 328 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  40.78 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  41.46 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  40.8 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.99 
 
 		 335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.56 
 
 		 332 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  42.51 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.05 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.05 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  40.43 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  42.48 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  40.92 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.84 
 
 		 336 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.19 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.8 
 
 		 330 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3993  hypothetical protein  41.25 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  39.64 
 
 		 330 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  40.86 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.68 
 
 		 328 aa  238  9e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  42.28 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.37 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  38.23 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  42.07 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  37.88 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  41.4 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  38.2 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  39.88 
 
 		 338 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.53 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  40.47 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  42.06 
 
 		 330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  41.64 
 
 		 334 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.73 
 
 		 328 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.53 
 
 		 339 aa  235  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  38.87 
 
 		 337 aa  235  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>