More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1498 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  713    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3851  hypothetical protein  61.93 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  59.24 
 
 		 315 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  57.14 
 
 		 332 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  57.24 
 
 		 331 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  57.44 
 
 		 331 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  58.13 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  54.34 
 
 		 337 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  56.96 
 
 		 328 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  56.32 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  53.94 
 
 		 334 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  54.97 
 
 		 328 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  52.58 
 
 		 323 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  52.58 
 
 		 323 aa  298  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  42.52 
 
 		 330 aa  271  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  43.54 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  42.47 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  41.38 
 
 		 335 aa  256  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  43.33 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  44.44 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  253  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  41.88 
 
 		 334 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  39.4 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  42.18 
 
 		 398 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  39.4 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  43.09 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  43.31 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  43.79 
 
 		 325 aa  242  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  44.29 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  42.52 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  40.06 
 
 		 324 aa  237  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  39.74 
 
 		 323 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  39.69 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  40.82 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  38.12 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  38.1 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  37.42 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  38.14 
 
 		 328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  41.61 
 
 		 323 aa  222  8e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  38.82 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  38.85 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  41.2 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.7 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.9 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.9 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  37.46 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.9 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.28 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.88 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.16 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  36.89 
 
 		 341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.5 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  36.65 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.06 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  36.98 
 
 		 698 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  36.24 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  36.24 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  38.41 
 
 		 329 aa  210  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  38.38 
 
 		 345 aa  209  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  38.31 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  35.42 
 
 		 333 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  38.38 
 
 		 345 aa  208  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  35.25 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  38.75 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  39.66 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.33 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  36.55 
 
 		 337 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  34.97 
 
 		 327 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  34.21 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  36.51 
 
 		 343 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  39.17 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  34.74 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  36.39 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.07 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.73 
 
 		 331 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  37.5 
 
 		 360 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.62 
 
 		 327 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.39 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  35.28 
 
 		 341 aa  202  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  35.93 
 
 		 329 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  35.48 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  37.29 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  34.85 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  36.95 
 
 		 353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  37.37 
 
 		 386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  36.1 
 
 		 329 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  35.49 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  36.45 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  34.68 
 
 		 328 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  34.68 
 
 		 328 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  36.39 
 
 		 344 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  37.11 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  34.3 
 
 		 318 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  34.91 
 
 		 332 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  36.52 
 
 		 324 aa  196  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  37.37 
 
 		 343 aa  195  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  35.31 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  37.72 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  38.21 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>