More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3143 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  651    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  80.56 
 
 		 324 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  72 
 
 		 324 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  69.18 
 
 		 329 aa  448  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  69.18 
 
 		 329 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  69.44 
 
 		 330 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  66.99 
 
 		 328 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  65.31 
 
 		 325 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  64.33 
 
 		 328 aa  428  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  64.71 
 
 		 329 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  67.76 
 
 		 329 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  53.78 
 
 		 328 aa  358  6e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  58.97 
 
 		 325 aa  358  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  57.43 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  54.79 
 
 		 330 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  56.72 
 
 		 331 aa  355  7.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  57.63 
 
 		 327 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  53.89 
 
 		 330 aa  347  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  54.31 
 
 		 328 aa  345  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  56.33 
 
 		 325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  52 
 
 		 328 aa  342  5e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  58.09 
 
 		 328 aa  342  5.999999999999999e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  57.76 
 
 		 327 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  54.61 
 
 		 334 aa  339  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  53.57 
 
 		 358 aa  335  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  52.63 
 
 		 335 aa  333  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  51.97 
 
 		 335 aa  325  6e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  51.97 
 
 		 335 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  54.26 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  50.16 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  43.89 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  45 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  45 
 
 		 331 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  44.04 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  45.33 
 
 		 331 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.85 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  44.15 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  44.15 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.97 
 
 		 330 aa  235  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  41.39 
 
 		 351 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.67 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  38.41 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.33 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  40.94 
 
 		 328 aa  231  9e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.69 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  41.1 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.69 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  42.37 
 
 		 329 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.14 
 
 		 331 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  42.46 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  42.27 
 
 		 324 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  44.22 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  43.45 
 
 		 328 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.76 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  39.22 
 
 		 337 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  39.46 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  41.45 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.12 
 
 		 353 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  40.13 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.81 
 
 		 328 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  40.82 
 
 		 332 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.57 
 
 		 326 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.82 
 
 		 331 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.8 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  39.3 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.94 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 		 358 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.12 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.58 
 
 		 335 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  39.27 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.86 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.14 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  39.51 
 
 		 330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  37.06 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.63 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.65 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4008  hypothetical protein  40.64 
 
 		 335 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0970  hypothetical protein  40.2 
 
 		 337 aa  215  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  39.94 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  39.02 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  39.87 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  38.74 
 
 		 315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  38.92 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  40 
 
 		 698 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.5 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.61 
 
 		 339 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  40.13 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  39.41 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  36.59 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.86 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.86 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.04 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  37.86 
 
 		 343 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  38.28 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.91 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.93 
 
 		 349 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  36.84 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  38.17 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  39.25 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  36.51 
 
 		 321 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>