More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0488 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  667    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  81.37 
 
 		 324 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  80.13 
 
 		 330 aa  519  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  74.77 
 
 		 329 aa  500  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  74.77 
 
 		 329 aa  499  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  69.3 
 
 		 329 aa  474  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  64.42 
 
 		 324 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  61.8 
 
 		 325 aa  421  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  66.99 
 
 		 323 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  60.49 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  62.7 
 
 		 329 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  53.07 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  51.86 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  54.33 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  54.18 
 
 		 398 aa  332  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  51.07 
 
 		 328 aa  330  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  50.65 
 
 		 328 aa  328  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  51.52 
 
 		 325 aa  328  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  51.08 
 
 		 330 aa  328  8e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  52.53 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  50.3 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  51.16 
 
 		 331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  52.24 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  50.61 
 
 		 327 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  49.35 
 
 		 335 aa  316  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  51.66 
 
 		 334 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  49.83 
 
 		 335 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  49.17 
 
 		 335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  47.65 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  45.66 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  42.76 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.19 
 
 		 328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.19 
 
 		 328 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.76 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  40.27 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.45 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  39.86 
 
 		 329 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  40.26 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  37.07 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.99 
 
 		 328 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  40.13 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.8 
 
 		 331 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  36.62 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  40.13 
 
 		 331 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  40.13 
 
 		 331 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.2 
 
 		 339 aa  222  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.96 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.93 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  38.33 
 
 		 338 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  41.88 
 
 		 331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.64 
 
 		 314 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  37.76 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.64 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  40.2 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  37.54 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  36.39 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  36.91 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  38.46 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  40.47 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  36.71 
 
 		 327 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  38.64 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  37.24 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  38.64 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  38.76 
 
 		 328 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  39.47 
 
 		 332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  38 
 
 		 344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  38 
 
 		 341 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.26 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.7 
 
 		 326 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  40.13 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 358 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.37 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38.24 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  37.5 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  35.19 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.27 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  38.83 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  41.69 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.81 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  37.25 
 
 		 331 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  36.27 
 
 		 337 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  39.25 
 
 		 322 aa  209  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.14 
 
 		 328 aa  209  8e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  39.74 
 
 		 334 aa  208  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  35.93 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.53 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  36.45 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.94 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  40.47 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  39.06 
 
 		 698 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.37 
 
 		 327 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.08 
 
 		 329 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  37.83 
 
 		 330 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  39.48 
 
 		 353 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.37 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.05 
 
 		 351 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.42 
 
 		 331 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  36.56 
 
 		 336 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4992  hypothetical protein  37.17 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  38.96 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>