212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0426 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0441  segregation and condensation protein B  100 
 
 		 167 aa  332  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0426  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  332  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1463  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  123  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1302  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.941912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.86 
 
 		 196 aa  85.5  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.73 
 
 		 190 aa  84.3  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.99 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.82 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.81 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  30.2 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  34.9 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.89 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  30.23 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0350  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.64 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  29.3 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  29.53 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  28.95 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  29.94 
 
 		 282 aa  74.3  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.72 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.18 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  30.87 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  36.24 
 
 		 201 aa  72  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 179 aa  72  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  30.18 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.54 
 
 		 273 aa  70.9  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  29.68 
 
 		 251 aa  71.2  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  29.3 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  29.53 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  32.05 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  32.23 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  28.86 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.86 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  27.39 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.07 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1300  hypothetical protein  36 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  29.14 
 
 		 299 aa  68.2  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  30.92 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  30.92 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.12 
 
 		 387 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  30.66 
 
 		 372 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.15 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  30.92 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  30.26 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  28.77 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  27.03 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  30.92 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  30.92 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.87 
 
 		 534 aa  65.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  30.92 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  30.92 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  28.19 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  28.76 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  28.86 
 
 		 352 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  29.53 
 
 		 284 aa  64.3  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  27.85 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  30.26 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  28.48 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  32.89 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  32.89 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  26.35 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.5 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  27.22 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  25.66 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.08 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.71 
 
 		 320 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  27.45 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  29.38 
 
 		 241 aa  62  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  26.85 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  31.78 
 
 		 353 aa  61.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  29.41 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  30.72 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.92 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  23.84 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.28 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  27.45 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  24.32 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.28 
 
 		 279 aa  58.2  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1497  condensin subunit ScpB  25.17 
 
 		 367 aa  58.2  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000476925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  27.08 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.1 
 
 		 197 aa  57.4  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.29 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.89 
 
 		 237 aa  57.4  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491484  decreased coverage  0.00429579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  26.77 
 
 		 229 aa  57.4  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2154  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.26 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0900248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0601  chromosomal segregation and condensation protein B  29.41 
 
 		 209 aa  57  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  27.34 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  27.34 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  27.34 
 
 		 231 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.47 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1533  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.51 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000760349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  27.15 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  28.48 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  29.69 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.35 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>