139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1302 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1302  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  353  7.999999999999999e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.941912  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1463  putative transcriptional regulator  51.53 
 
 		 193 aa  173  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0426  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0441  segregation and condensation protein B  40.38 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.93 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.57 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.76 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  26.09 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  30.41 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  29.73 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  26.74 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  25.68 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  29.78 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  29.78 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  29.78 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  29.78 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  29.78 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  29.78 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  29.78 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  29.73 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  28.74 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.38 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4166  segregation and condensation protein B  28.74 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.178731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.25 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.77 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0887  transcriptional regulator  25.31 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000169803 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  26.8 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  24.54 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  25.19 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  25.19 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  26.35 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  24.7 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.46 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.95 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.84 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3886  segregation and condensation protein B  26.16 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  26.9 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  23.4 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3277  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 		 241 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.79 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  25.5 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  25.66 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2456  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.07 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.70211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  28.57 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  27.7 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  23.95 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.62 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  23.31 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  27.45 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  24.66 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  24.8 
 
 		 252 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.01 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  24.16 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2496  condensin subunit ScpB  27.85 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  21.47 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11725  hypothetical protein  25.61 
 
 		 231 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.311504 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  28.95 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  28.86 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  27.39 
 
 		 352 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  27.7 
 
 		 221 aa  52  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.78 
 
 		 261 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0559591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1005  condensin subunit ScpB  25.66 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1551  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1582  segregation and condensation protein B  26.36 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2818  segregation and condensation protein B  26.58 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0991332  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  27.19 
 
 		 243 aa  51.2  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09921  transcription regulator  29.63 
 
 		 160 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  24.36 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  29.05 
 
 		 189 aa  51.2  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2372  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.53 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.505721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.87 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.71 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  27.34 
 
 		 238 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  24.83 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.76 
 
 		 279 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.03 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  25.34 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1453  condensin subunit ScpB  20.95 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683663 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  27.27 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  23.97 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  27.92 
 
 		 195 aa  47.8  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  28.35 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  22.07 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  22.45 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0891  condensin subunit ScpB  30.08 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.56 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  24.31 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.48 
 
 		 269 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  26.35 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.13 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  27.98 
 
 		 385 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  19.05 
 
 		 251 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  28.1 
 
 		 222 aa  45.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  21.68 
 
 		 274 aa  45.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  22.43 
 
 		 253 aa  45.1  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  22.97 
 
 		 284 aa  45.1  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>