93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0891 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0891  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 154 aa  307  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09921  transcription regulator  82.88 
 
 		 160 aa  256  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09701  transcription regulator  56.93 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0684332  normal  0.14111 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0298  condensin subunit ScpB  56.2 
 
 		 168 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1432  condensin subunit ScpB  54.29 
 
 		 165 aa  165  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1067  putative transcriptional regulator  53.57 
 
 		 165 aa  163  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.714115  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09501  hypothetical protein  92.94 
 
 		 85 aa  161  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.781091  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09521  hypothetical protein  91.76 
 
 		 85 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.522022  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15391  transcription regulator  49.34 
 
 		 177 aa  153  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08501  transcription regulator  47.14 
 
 		 179 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152979  hitchhiker  0.00163569 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0426  condensin subunit ScpB  47.41 
 
 		 183 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1721  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.07 
 
 		 164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000287131  hitchhiker  0.000910071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3666  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.76 
 
 		 160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0308  chromosome segregation and condensation protein ScpB  42.21 
 
 		 191 aa  134  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1105  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.61 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1132  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.88 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000469648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2413  condensin subunit ScpB  39.61 
 
 		 177 aa  124  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000581218  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1880  condensin subunit ScpB  41.48 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0594  condensin subunit ScpB  37.04 
 
 		 371 aa  95.9  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0592  putative transcriptional regulator  30.82 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.641435  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1497  condensin subunit ScpB  28.15 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000476925  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1099  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.87 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0366895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.78 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  27.91 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  26.39 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  24.82 
 
 		 387 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0521  chromosome segregation and condensation protein ScpB  30.07 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.4 
 
 		 387 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  23.4 
 
 		 372 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  24.66 
 
 		 195 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  24.82 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  23.97 
 
 		 195 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  27.74 
 
 		 237 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  27.59 
 
 		 198 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  26.77 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  25.55 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  21.28 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1463  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  19.72 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  23.57 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.24 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  23.08 
 
 		 282 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  24.46 
 
 		 199 aa  48.1  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  18.62 
 
 		 243 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.37 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  21.68 
 
 		 284 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  22.73 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  24.11 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  24.68 
 
 		 206 aa  44.7  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0441  segregation and condensation protein B  25 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0426  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  24.63 
 
 		 192 aa  44.3  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  20.3 
 
 		 253 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  22.76 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  26.06 
 
 		 236 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.81 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  24 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0722  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.91 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00466687  normal  0.0828355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2137  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  22.54 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1555  segregation and condensation protein B  27.2 
 
 		 247 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00574498  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1611  putative transcriptional regulator  27.2 
 
 		 254 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.499077  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  24.14 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  24.14 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  22.6 
 
 		 222 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  24.41 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  20.98 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  24.14 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  24.14 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1302  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.941912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  26.57 
 
 		 263 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  21.05 
 
 		 251 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1591  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.35 
 
 		 200 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  18.79 
 
 		 196 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  20.28 
 
 		 246 aa  42.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  24.14 
 
 		 198 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25340  condensin subunit ScpB  23.21 
 
 		 252 aa  41.2  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.477855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  23.13 
 
 		 226 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1570  condensin subunit ScpB  24.82 
 
 		 183 aa  40.8  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.343062  normal  0.779197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  28.7 
 
 		 257 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  18.75 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  24.82 
 
 		 186 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  24.14 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  24.14 
 
 		 198 aa  40.8  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  19.58 
 
 		 254 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  24.14 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.14 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  22.95 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  23.29 
 
 		 198 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  24.14 
 
 		 198 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  28.7 
 
 		 255 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  29.93 
 
 		 193 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>