116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_09921 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_09921  transcription regulator  100 
 
 		 160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0891  condensin subunit ScpB  82.88 
 
 		 154 aa  256  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09701  transcription regulator  56 
 
 		 168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0684332  normal  0.14111 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0298  condensin subunit ScpB  55.33 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1432  condensin subunit ScpB  53.06 
 
 		 165 aa  170  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1067  putative transcriptional regulator  53.06 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.714115  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15391  transcription regulator  51.02 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08501  transcription regulator  49.66 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152979  hitchhiker  0.00163569 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0426  condensin subunit ScpB  47.59 
 
 		 183 aa  154  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09521  hypothetical protein  89.16 
 
 		 85 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.522022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1721  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.95 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000287131  hitchhiker  0.000910071 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09501  hypothetical protein  87.95 
 
 		 85 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.781091  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3666  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  43.23 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1105  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.28 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1132  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.61 
 
 		 157 aa  140  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000469648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1880  condensin subunit ScpB  42.28 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0308  chromosome segregation and condensation protein ScpB  41.78 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2413  condensin subunit ScpB  41.1 
 
 		 177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000581218  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0594  condensin subunit ScpB  36.36 
 
 		 371 aa  100  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0592  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 		 343 aa  90.5  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.641435  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1497  condensin subunit ScpB  27.27 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000476925  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1099  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.63 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0366895  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.48 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  27.21 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  25.85 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  27.27 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  23.33 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  26.32 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  25.66 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0521  chromosome segregation and condensation protein ScpB  30.77 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  25.17 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  25 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  25.33 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  21.94 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  25 
 
 		 372 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.27 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  25.17 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1463  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  26.32 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1591  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.88 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  26.49 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  28.22 
 
 		 210 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.18 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  25.97 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  26.28 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  26.28 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  26.28 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  26.28 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 		 214 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  25.15 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  23.24 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  21.94 
 
 		 274 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.64 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  22.82 
 
 		 284 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  19.87 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.23 
 
 		 193 aa  48.5  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.67 
 
 		 196 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  22.3 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  22.67 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.48 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  23.23 
 
 		 222 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  25.16 
 
 		 206 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1302  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 181 aa  47.8  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.941912  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  21.62 
 
 		 228 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  25.32 
 
 		 226 aa  47.8  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  24.34 
 
 		 245 aa  47.4  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  25.64 
 
 		 198 aa  47.4  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  21.05 
 
 		 282 aa  47.4  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  21.57 
 
 		 165 aa  47.4  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  24.59 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.5 
 
 		 534 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.58 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  21.15 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.77 
 
 		 193 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  23.33 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.77 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  23.33 
 
 		 231 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  20.49 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  23.08 
 
 		 231 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  22.15 
 
 		 237 aa  45.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  23.08 
 
 		 231 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  24.36 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  25.83 
 
 		 236 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  22.44 
 
 		 243 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  25.81 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1166  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.62 
 
 		 209 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2990  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.77 
 
 		 279 aa  44.3  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  23.03 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1570  condensin subunit ScpB  23.03 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.343062  normal  0.779197 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  22.22 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  21.48 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2248  putative transcriptional regulator  25.85 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540611  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3121  putative transcriptional regulator  22.58 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158109  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  26.92 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>