203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0521 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0521  chromosome segregation and condensation protein ScpB  100 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0594  condensin subunit ScpB  34.76 
 
 		 371 aa  99  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0592  putative transcriptional regulator  34.67 
 
 		 343 aa  95.1  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.641435  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1497  condensin subunit ScpB  30.3 
 
 		 367 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000476925  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1099  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.19 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0366895  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1880  condensin subunit ScpB  34.57 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1067  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.714115  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1432  condensin subunit ScpB  35.71 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2413  condensin subunit ScpB  34.62 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000581218  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0426  condensin subunit ScpB  31.64 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15391  transcription regulator  33.76 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0308  chromosome segregation and condensation protein ScpB  33.11 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.93 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  25.88 
 
 		 282 aa  68.2  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08501  transcription regulator  33.33 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152979  hitchhiker  0.00163569 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1132  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.88 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000469648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1105  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.19 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  29.28 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1721  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.76 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000287131  hitchhiker  0.000910071 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  29.45 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  31.95 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  30.11 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0756  condensin subunit ScpB  28.57 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000117141  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3666  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.61 
 
 		 160 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 168 aa  62  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.57 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.23 
 
 		 387 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  29.23 
 
 		 372 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  29.38 
 
 		 302 aa  61.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  28.12 
 
 		 311 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  29.41 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.48 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  31.37 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  29.27 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09921  transcription regulator  30.77 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  26.88 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  30.72 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1468  segregation and condensation protein B  29.41 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  26.44 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  28.99 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1791  segregation and condensation protein B  29.41 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  28.8 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  28.99 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  25.86 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  26.95 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  28.49 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  28.49 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  28.49 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  28.92 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  28.49 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  30.72 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  29.56 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  28.92 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.25 
 
 		 389 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  26.25 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  30.18 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  27.17 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  29.68 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  30.18 
 
 		 345 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  29.89 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  33.94 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  30.18 
 
 		 345 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  28.92 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  29.45 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  25.27 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  30.77 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  30.18 
 
 		 343 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  26.9 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  28.24 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  28.24 
 
 		 455 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  28.24 
 
 		 456 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  30.32 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  27.37 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  28.24 
 
 		 456 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0601  chromosomal segregation and condensation protein B  32.69 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  29.49 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  25.45 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  26.97 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0891  condensin subunit ScpB  30.07 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  26.49 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.22 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.97 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.12 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1591  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.65 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.51 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09701  transcription regulator  27.1 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0684332  normal  0.14111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  28.3 
 
 		 394 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  28.83 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.66 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0298  condensin subunit ScpB  27.1 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1257  condensin subunit ScpB  26.99 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  29.78 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3862  condensin subunit ScpB  32.03 
 
 		 353 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.857603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>