157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1880 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1880  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 173 aa  349  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2413  condensin subunit ScpB  66.67 
 
 		 177 aa  219  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000581218  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0308  chromosome segregation and condensation protein ScpB  66.88 
 
 		 191 aa  213  8e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1721  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  62.09 
 
 		 164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000287131  hitchhiker  0.000910071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3666  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  65.79 
 
 		 160 aa  211  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1132  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  63.82 
 
 		 157 aa  208  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000469648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1105  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  63.16 
 
 		 157 aa  208  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0426  condensin subunit ScpB  62.59 
 
 		 183 aa  197  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1432  condensin subunit ScpB  49.69 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15391  transcription regulator  51.01 
 
 		 177 aa  154  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0298  condensin subunit ScpB  49.35 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1067  putative transcriptional regulator  46.54 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.714115  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09701  transcription regulator  49.35 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0684332  normal  0.14111 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08501  transcription regulator  49.32 
 
 		 179 aa  147  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152979  hitchhiker  0.00163569 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09921  transcription regulator  42.28 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0891  condensin subunit ScpB  41.48 
 
 		 154 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1497  condensin subunit ScpB  33.13 
 
 		 367 aa  96.3  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000476925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0594  condensin subunit ScpB  34.27 
 
 		 371 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1099  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.93 
 
 		 165 aa  89.4  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0366895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0592  putative transcriptional regulator  34.27 
 
 		 343 aa  82  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.641435  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0521  chromosome segregation and condensation protein ScpB  34.57 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09521  hypothetical protein  56.45 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.522022  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09501  hypothetical protein  56.45 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.781091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  28.16 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  29.82 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1166  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.93 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  31.98 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.07 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  27.91 
 
 		 193 aa  62  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1591  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.39 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  23.26 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  34.94 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  34.94 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.69 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  27.06 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1368  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.66 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  29.21 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  26.53 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  26.51 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  28.72 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  25.57 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  28.81 
 
 		 299 aa  53.9  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  29.71 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.34 
 
 		 269 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  28.39 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  29.49 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  27.75 
 
 		 250 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  29.49 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  29.49 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  29.49 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  29.07 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3967  segregation and condensation protein B  29.71 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3798  segregation and condensation protein B  29.71 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4276  segregation and condensation protein B  29.71 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4077  segregation and condensation protein B  29.71 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000355758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 210 aa  52.4  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  28.99 
 
 		 226 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  29.11 
 
 		 221 aa  52  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  29.14 
 
 		 190 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3813  segregation and condensation protein B  29.14 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 198 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  28.65 
 
 		 201 aa  51.2  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.85 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  28.99 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.39 
 
 		 196 aa  50.8  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2012  segregation and condensation protein B  29.88 
 
 		 236 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0659243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4055  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.93 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.692902 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  26.71 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  22.99 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 245 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.04 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0350  chromosome segregation and condensation protein ScpB  25.52 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.93 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  22.38 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.6 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  28.38 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  24.1 
 
 		 243 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1057  segregation and condensation protein B  30.32 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.68 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  28 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  30.87 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  32.12 
 
 		 259 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  30.06 
 
 		 287 aa  48.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  25.88 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1721  condensin subunit ScpB  29.88 
 
 		 352 aa  47.8  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.862733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 210 aa  47.8  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  24.53 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  22.36 
 
 		 252 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0441  segregation and condensation protein B  24.71 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  25.17 
 
 		 372 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0426  putative transcriptional regulator  24.71 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.17 
 
 		 387 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  30.67 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>