109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_09701 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_09701  transcription regulator  100 
 
 		 168 aa  337  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0684332  normal  0.14111 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0298  condensin subunit ScpB  98.21 
 
 		 168 aa  333  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15391  transcription regulator  71.6 
 
 		 177 aa  234  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08501  transcription regulator  67.9 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152979  hitchhiker  0.00163569 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1432  condensin subunit ScpB  68.21 
 
 		 165 aa  218  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1067  putative transcriptional regulator  64.9 
 
 		 165 aa  206  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.714115  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09921  transcription regulator  56 
 
 		 160 aa  181  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0891  condensin subunit ScpB  56.93 
 
 		 154 aa  171  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1721  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.95 
 
 		 164 aa  167  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000287131  hitchhiker  0.000910071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0426  condensin subunit ScpB  48.26 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3666  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  49.33 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0308  chromosome segregation and condensation protein ScpB  49.66 
 
 		 191 aa  154  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2413  condensin subunit ScpB  50 
 
 		 177 aa  153  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000581218  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1880  condensin subunit ScpB  49.35 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1105  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.4 
 
 		 157 aa  151  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1132  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  47.4 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000469648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09521  hypothetical protein  74.63 
 
 		 85 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.522022  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09501  hypothetical protein  74.63 
 
 		 85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.781091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0594  condensin subunit ScpB  35.66 
 
 		 371 aa  93.6  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1497  condensin subunit ScpB  30.07 
 
 		 367 aa  85.1  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000476925  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0592  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 		 343 aa  74.7  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.641435  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1099  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.37 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0366895  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  28.57 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  25.5 
 
 		 299 aa  58.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  27.92 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  26.83 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  25.97 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  31.61 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.07 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1166  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.64 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0521  chromosome segregation and condensation protein ScpB  27.1 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  25 
 
 		 387 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  25 
 
 		 372 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.17 
 
 		 193 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.15 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25 
 
 		 387 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  24.84 
 
 		 243 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  27.81 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.69 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  25.17 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  29.25 
 
 		 193 aa  51.6  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  28.35 
 
 		 284 aa  50.8  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  28.93 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.38 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  23.81 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 221 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  24.32 
 
 		 352 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  26.8 
 
 		 209 aa  48.9  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  23.94 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  26.58 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  25.6 
 
 		 282 aa  48.5  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  26.8 
 
 		 209 aa  48.1  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  29.41 
 
 		 256 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.57 
 
 		 269 aa  47.8  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2583  segregation and condensation protein B  24.84 
 
 		 189 aa  47.8  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000922249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  24.83 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  27.67 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  28.76 
 
 		 330 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  29.41 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1955  putative transcriptional regulator  26.97 
 
 		 219 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  28.76 
 
 		 259 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 238 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  28.1 
 
 		 257 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  28.1 
 
 		 255 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  26.79 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  28.76 
 
 		 332 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  23.33 
 
 		 282 aa  46.6  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2995  condensin subunit ScpB  25.98 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1467  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1463  putative transcriptional regulator  25.17 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  27.63 
 
 		 277 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  25.64 
 
 		 212 aa  45.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  26.19 
 
 		 224 aa  44.7  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  25 
 
 		 237 aa  44.7  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  25.17 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 		 255 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  23.39 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  27.45 
 
 		 337 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  24.79 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  24.59 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  27.71 
 
 		 250 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2974  condensin subunit ScpB  24.59 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  23.94 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  23.97 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7248  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.23 
 
 		 447 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000483064  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  27.82 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  27.82 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  27.82 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  27.82 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1724  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  28.35 
 
 		 228 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.870411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.49 
 
 		 211 aa  42.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  29.85 
 
 		 210 aa  42  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  23.42 
 
 		 197 aa  42  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.5 
 
 		 192 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  26.81 
 
 		 194 aa  41.6  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  26.85 
 
 		 211 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  28.1 
 
 		 263 aa  41.6  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 198 aa  40.8  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>