23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_09501 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_09501  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.781091  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09521  hypothetical protein  98.82 
 
 		 85 aa  170  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.522022  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0891  condensin subunit ScpB  92.94 
 
 		 154 aa  161  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09921  transcription regulator  87.95 
 
 		 160 aa  147  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0298  condensin subunit ScpB  74.63 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09701  transcription regulator  74.63 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0684332  normal  0.14111 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1067  putative transcriptional regulator  61.73 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.714115  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1432  condensin subunit ScpB  61.73 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15391  transcription regulator  57.14 
 
 		 177 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08501  transcription regulator  55.42 
 
 		 179 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152979  hitchhiker  0.00163569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1721  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.06 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000287131  hitchhiker  0.000910071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0426  condensin subunit ScpB  56.72 
 
 		 183 aa  86.3  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3666  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.52 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1105  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.62 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1132  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  53.62 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000469648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1880  condensin subunit ScpB  56.45 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0308  chromosome segregation and condensation protein ScpB  44.71 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2413  condensin subunit ScpB  48.75 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000581218  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0594  condensin subunit ScpB  47.83 
 
 		 371 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0592  putative transcriptional regulator  33.72 
 
 		 343 aa  47  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.641435  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1497  condensin subunit ScpB  34.78 
 
 		 367 aa  45.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000476925  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0521  chromosome segregation and condensation protein ScpB  33.33 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1099  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.92 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0366895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>