136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1432 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1432  condensin subunit ScpB  100 
 
 		 165 aa  327  4e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1067  putative transcriptional regulator  87.27 
 
 		 165 aa  293  6e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.714115  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15391  transcription regulator  73.94 
 
 		 177 aa  249  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08501  transcription regulator  63.98 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152979  hitchhiker  0.00163569 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09701  transcription regulator  68.21 
 
 		 168 aa  218  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0684332  normal  0.14111 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0298  condensin subunit ScpB  65.22 
 
 		 168 aa  217  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0426  condensin subunit ScpB  58.9 
 
 		 183 aa  177  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1721  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  56.21 
 
 		 164 aa  170  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000287131  hitchhiker  0.000910071 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09921  transcription regulator  53.06 
 
 		 160 aa  170  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3666  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  52.63 
 
 		 160 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0891  condensin subunit ScpB  54.29 
 
 		 154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2413  condensin subunit ScpB  54.48 
 
 		 177 aa  163  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000581218  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0308  chromosome segregation and condensation protein ScpB  50.96 
 
 		 191 aa  160  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1880  condensin subunit ScpB  49.69 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1105  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.33 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1132  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  50.98 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000469648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0594  condensin subunit ScpB  41.84 
 
 		 371 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09501  hypothetical protein  61.73 
 
 		 85 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.781091  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09521  hypothetical protein  60.49 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.522022  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1497  condensin subunit ScpB  35.46 
 
 		 367 aa  94.7  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000476925  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0592  putative transcriptional regulator  31.47 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.641435  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0521  chromosome segregation and condensation protein ScpB  35.71 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1099  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.77 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0366895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  31.93 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  27.67 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  27.04 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  27.22 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  29.56 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  29.11 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  30.34 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  26.54 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  25.79 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  26.92 
 
 		 387 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.92 
 
 		 387 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  26.92 
 
 		 372 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.2 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  28.75 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4629  putative transcriptional regulator  29.68 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00667306  hitchhiker  0.00065048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  27.45 
 
 		 198 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  29.73 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1166  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.03 
 
 		 209 aa  52.4  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  33.54 
 
 		 330 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  33.54 
 
 		 332 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.84 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.71 
 
 		 196 aa  51.2  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1831  hypothetical protein  26.17 
 
 		 195 aa  50.8  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4003  segregation and condensation protein B  31.82 
 
 		 256 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.577747  decreased coverage  0.000000530322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1813  conserved hypothetical protein TIGR00281  32.47 
 
 		 257 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  27.78 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  31.78 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  24.83 
 
 		 299 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  27.78 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3583  hypothetical protein  32.47 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.809895  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3786  segregation and condensation protein B  30.72 
 
 		 259 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000435187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1958  condensin subunit ScpB  28.46 
 
 		 195 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0110905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  27.85 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  26.9 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  28.89 
 
 		 198 aa  48.5  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  29.24 
 
 		 198 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  29.24 
 
 		 198 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  29.24 
 
 		 198 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  30.19 
 
 		 201 aa  47.8  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1415  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 255 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 352 aa  47.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3787  segregation and condensation protein B  28.39 
 
 		 274 aa  47.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.452854  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1490  condensin subunit ScpB  31.1 
 
 		 337 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4497  hypothetical protein  31.87 
 
 		 277 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.54 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15670  chromosome segregation and condensation protein B  31.82 
 
 		 263 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.95 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  26.4 
 
 		 250 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1161  putative transcriptional regulator  30.82 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4453  segregation and condensation protein B  29.56 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0472424  hitchhiker  0.0000000971246 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  26.72 
 
 		 284 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.22 
 
 		 534 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.86 
 
 		 234 aa  45.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.05 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  30.86 
 
 		 234 aa  45.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  27.64 
 
 		 282 aa  45.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  28.48 
 
 		 222 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  28.86 
 
 		 226 aa  45.1  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  26.76 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15200  condensin subunit ScpB  29.03 
 
 		 253 aa  45.1  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0138487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 198 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  28.74 
 
 		 214 aa  44.7  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  31.95 
 
 		 239 aa  44.7  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  22.64 
 
 		 237 aa  44.3  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  28.74 
 
 		 245 aa  44.3  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1591  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.05 
 
 		 200 aa  44.3  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 243 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  27.7 
 
 		 211 aa  44.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1839  condensin subunit ScpB  33.12 
 
 		 264 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0830751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2930  condensin subunit ScpB  27.87 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>